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甜菜全基因组SSR引物的筛选与评价
文献摘要：
旨在筛选出适合于甜菜分子生物学实验的SSR核心引物,为后续构建甜菜指纹图谱及遗传多样性分析奠定重要基础.本文利用4种不同的甜菜种质资源和4个不同的甜菜品种,对基于甜菜全基因组编码区序列设计的247对SSR引物进行了初步筛选.结果表明,247对引物中绝大多数引物没有多态性或者多态性不好,只有27对引物具有较高的多态性,这27对引物总共扩增出103条带,其中多态性条带95条,多态性比率为90.43％.这些引物多态性信息量(PIC)范围为0.549～0.983,平均每一对引物的PIC值为0.841.试验结果表明虽然经过了电子PCR的筛选,想要找到合适的甜菜SSR引物依然比较困难,说明甜菜的遗传基础比较狭窄.这27对SSR引物适用于甜菜分子标记,为甜菜品种标准化鉴定体系的大规模构建和应用奠定了重要基础.
文献关键词：
甜菜;分子标记;简单序列重复;引物筛选;多态性信息含量
中图分类号：
作者姓名：
李乔乔;王宇晴;刘蕊;刘乃新;邳植;吴则东
作者机构：
黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨150080;黑龙江省普通高校甜菜遗传育种重点实验室/黑龙江大学,哈尔滨150080;黑龙江种业技术服务中心,哈尔滨150008
文献出处：
引用格式：
[1]李乔乔;王宇晴;刘蕊;刘乃新;邳植;吴则东-.甜菜全基因组SSR引物的筛选与评价)[J].中国农学通报,2022(12):95-99
A类：
B类：
全基因组,SSR,筛选与评价,分子生物学实验,核心引物,指纹图谱,遗传多样性分析,菜种,种质资源,甜菜品种,编码区,序列设计,初步筛选,总共,条带,性比率,信息量,PIC,遗传基础,分子标记,品种标准,构建和应用,简单序列重复,引物筛选,多态性信息含量
AB值：
0.301229
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