典型文献
基于微卫星标记的山西糜子资源DNA二维码创建
文献摘要:
通过鉴定糜子种质资源,构建分子身份证,旨在为其保护遗传多样性提供理论依据,以来源于山西黄土高原生态区的21份糜子资源为材料,利用12个SSR标记(六碱基、五碱基和四碱基核苷酸重复序列分别为1、4、7对)筛选出9个遗传稳定性高、重复性好的标记,进行遗传多样性分析,利用相关软件构建材料的DNA二维码.结果表明,21份材料在12个位点的遗传多样性参数的观测等位基因平均为3.0000;有效等位基因介于2.5412~2.9959,平均为2.8412;多态性信息含量介于0.6010~0.7720,平均为0.7076;多样性指数介于0.9958~1.0979,平均为1.0661;观测杂合度介于0.5294~0.8883,平均为0.7058;期望杂合度介于0.6238~0.6842,平均为0.6646;Nei′s期望杂合度介于0.6065~0.6662,平均为0.6469.3个核心标记(RYW5、RYW8、RYW11)与其他标记相比相似系数过高,进行剔除处理;基于9个标记(RYW1、RYW2、RYW3、RYW4、RYW6、RYW7、RYW9、RYW10和RYW12)可以将21份材料全部区分.利用条形码在线软件与在线二维码技术分别构建了21份糜子资源的条形码和二维码.
文献关键词:
糜子;微卫星;DNA二维码;种质资源
中图分类号:
作者姓名:
杨哲;陈凌;王海岗;王瑞云;乔治军
作者机构:
山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室,山西 太原 030031
文献出处:
引用格式:
[1]杨哲;陈凌;王海岗;王瑞云;乔治军-.基于微卫星标记的山西糜子资源DNA二维码创建)[J].山西农业科学,2022(04):504-509
A类:
RYW11,RYW2,RYW4,RYW9,RYW12
B类:
微卫星标记,糜子,通过鉴定,种质资源,分子身份证,黄土高原,原生态,生态区,SSR,碱基核苷,重复序列,遗传稳定性,遗传多样性分析,相关软件,软件构建,建材,个位,遗传多样性参数,等位基因,多态性信息含量,多样性指数,杂合度,Nei,RYW5,RYW8,相似系数,RYW3,RYW6,RYW7,RYW10,条形码,二维码技术
AB值:
0.360818
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