典型文献
滇黄精转录组SSR位点信息分析
文献摘要：
以滇黄精转录组测序所获得的53081条Unigene为试材,采用MicroSAtellite(MISA)软件检索出滇黄精的SSR位点,研究其分布频率和重复基序类型等特征,并利用Primer 3.0软件对检索出的SSR基序设计引物,筛选出符合要求的引物对,以期为滇黄精遗传连锁图谱的绘制、优良品种的辅助育种、种间的分子鉴别等研究提供参考依据.结果表明:在滇黄精转录组中共检索出9037个SSR位点,分布于6960条Unigene中,SSR位点的发生频率是13.11％.单核苷酸重复是滇黄精SSR主要基序类型,其中尤以A/T基序的出现频率最高,占SSR位点总数的54.00％.通过设计与筛选,最终获得10320个SSR引物对.滇黄精转录组中的SSR位点具有丰富的类型,较高的出现频率以及较高的多态性潜能,为滇黄精SSR分子标记的开发与应用奠定了基础.
文献关键词：
滇黄精;转录组;SSR;位点信息
中图分类号：
作者姓名：
陈浩;钱华丽;徐哲;苏建云;陈小磊;季鹏章
作者机构：
云南中医药大学 中药学院,云南 昆明650500
文献出处：
引用格式：
[1]陈浩;钱华丽;徐哲;苏建云;陈小磊;季鹏章-.滇黄精转录组SSR位点信息分析)[J].北方园艺,2022(22):104-109
A类：
MicroSAtellite
B类：
滇黄精,SSR,位点信息,信息分析,转录组测序,Unigene,MISA,分布频率,基序,Primer,引物,符合要求,遗传连锁图谱,优良品种,辅助育种,种间,分子鉴别,在滇,发生频率,单核苷酸,尤以,多态性,分子标记,开发与应用
AB值：
0.286173
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