典型文献
水稻产量相关性状的全基因组关联分析及候选基因筛选
文献摘要:
水稻是最重要的粮食作物之一,培育高产稳产的水稻品种对于维护粮食安全至关重要,对产量相关性状的遗传解析是提高水稻产量的基础.本文从"3000份水稻核心种质重测序项目"(3K Rice Genome Project)中挑选生育期较为一致的226份核心种质资源材料考察生育期(rice growing period,RGP)、株高(plant height,PH)、有效穗数(effective panicle number,EPN)、穗长(panicle length,PL)、穗着粒密度(spikelet density,SD)、结实率(seed setting rate,SSR)、千粒重(thousand grains weight,TGW)、单株产量(yield per plant,YP)、每穗颖花数(spikelet per panicle,SP)、每穗实粒数(grains per panicle,GP)10个主要农艺性状,结合2429 kb的高密度基因型数据进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS).共定位到显著相关位点43个,除了qRGP7.2、qPH12、qPL6.2、qSD6.2、qTGW1.1、qGP1、qGP5.27个QTLs以外,其余36个QTL为本研究中定位到的新位点.此外,本研究利用单核苷酸位点功能评估的方式筛选到6个主要农艺性状相关候选基因.分别为株高相关基因LOC_Os12g18760、有效穗数相关基因LOC_Os03g33530、穗长相关基因LOC_Os06g30940、千粒重相关基因LOC_Os01g49810、单株产量相关基因LOC_Os09g25260、穗着粒密度和每穗颖花数相关基因LOC_Os09g32620.本研究结果将为水稻产量遗传改良提供理论参考与重要基因资源.
文献关键词:
水稻;产量;关联分析;候选基因;遗传改良
中图分类号:
作者姓名:
杨飞;张征锋;南波;肖本泽
作者机构:
华中农业大学植物科学技术学院,湖北武汉 430070;华中师范大学生命科学学院,湖北武汉 430079
文献出处:
引用格式:
[1]杨飞;张征锋;南波;肖本泽-.水稻产量相关性状的全基因组关联分析及候选基因筛选)[J].作物学报,2022(07):1813-1821
A类:
qRGP7,qPH12,qPL6,qSD6,qTGW1,qGP1,qGP5,Os12g18760,Os03g33530,Os06g30940,Os01g49810,Os09g25260,Os09g32620
B类:
水稻产量,产量相关性状,全基因组关联分析,候选基因筛选,粮食作物,高产稳产,水稻品种,遗传解析,核心种质,重测序,3K,Rice,Genome,Project,生育期,种质资源,资源材料,rice,growing,period,株高,plant,height,有效穗数,effective,panicle,number,EPN,穗长,length,spikelet,density,结实率,seed,setting,rate,SSR,千粒重,thousand,grains,weight,单株产量,yield,YP,颖花,SP,实粒数,主要农艺性状,kb,基因型,genome,wide,association,study,GWAS,共定位,QTLs,研究利用,单核苷酸,酸位点,功能评估,LOC,长相,粒重相关基因,遗传改良,基因资源
AB值:
0.355589
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