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烟草TPP基因家族鉴定及表达模式分析
文献摘要：
海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)是植物海藻糖代谢过程的关键酶,在植物的生长发育及非生物胁迫响应过程中发挥着重要的作用.为挖掘参与烟草发育及抗逆胁迫的TPP基因家族成员,本研究通过生物信息学的方法,在普通烟草基因组中共鉴定出了15个TPP基因,其中7个TPP基因定位在染色体上.系统进化分析发现,新鉴定的烟草TPP成员可分为3个亚家族,分别为CLASS I、CLASSⅡ和CLASSⅢ.共线性分析表明,有5个烟草NtTPP基因分别与7个拟南芥AtTPP基因形成同源基因对.启动子分析发现,NtTPP成员的启动子上存在多种激素和非生物胁迫响应元件.表达模式分析发现,NtTPP基因表达具有一定的组织特异性,大部分NtTPP基因在根中的表达量最高,有12个NtTPP基因在干旱胁迫下表达量上调,13个NtTPP基因能够被盐胁迫显著诱导表达.这说明NtTPP基因家族成员在烟草非生物胁迫应答中发挥着重要作用.
文献关键词：
烟草;海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP);干旱胁迫;盐胁迫;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
刘涛;郭存;邹宗庆;金立权;吴健;文利超;邓智超;初雨蒙;王凌涛;李伟;郭永峰
作者机构：
中国农业科学院烟草研究所,烟草行业基因资源利用重点实验室,青岛 266101;中国农业科学院研究生院,北京 100081;云南省烟草公司昆明市公司石林分公司,昆明 650000;福建省烟草公司龙岩市公司,福建 龙岩 361000;山东临沂烟草有限公司兰陵分公司,山东 临沂 277700;湖北省烟草公司十堰市公司竹溪县营销部,湖北 十堰 442300
文献出处：
引用格式：
[1]刘涛;郭存;邹宗庆;金立权;吴健;文利超;邓智超;初雨蒙;王凌涛;李伟;郭永峰-.烟草TPP基因家族鉴定及表达模式分析)[J].中国烟草科学,2022(06):1-8,16
A类：
NtTPP,AtTPP
B类：
基因家族鉴定,表达模式分析,海藻糖代谢,代谢过程,关键酶,非生物胁迫,胁迫响应,响应过程,抗逆,普通烟草,基因定位,系统进化分析,亚家族,CLASS,共线性分析,拟南芥,同源基因,启动子分析,响应元,组织特异性,干旱胁迫,盐胁迫,诱导表达,胁迫应答
AB值：
0.21774
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