典型文献
普通烟草NAC转录因子家族抗逆基因筛选与表达分析
文献摘要：
[背景和目的]NAC(NAM/ATAF/CUS2)家族是植物特有且最大的转录因子家族之一,广泛参与植物的生长发育调控和逆境胁迫应答.为筛选烟草抗逆NAC目标基因.[方法]以公开的普通烟草品种K326的注释蛋白序列为参考,与拟南芥NAC蛋白序列同源比对,结合功能域分析,进行普通烟草的NAC转录因子鉴定,并利用生物信息学软件分析各烟草NAC转录因子的理化性质及系统进化关系.使用普通烟草TobEA表达谱数据对烟草NAC家族成员组织表达模式进行分析,通过qRT-PCR检测候选抗逆基因所在亚组AtNAC3和ATAF各成员在干旱、冷害、盐、ABA处理下的基因表达情况.[结果]从普通烟草中共鉴定出190个NtabNAC蛋白,平均氨基酸长度为347,除NtabNAC190外,其余蛋白为亲水性蛋白,大多数定位在细胞核.根据系统进化分析,将拟南芥和烟草NAC家族基因划分为18个亚组,各亚组基因在不同组织中显示表达特异性.AtNAC3和ATAF亚组的9个烟草NAC基因,在受到干旱、冷害、盐和ABA处理后基因表达量上调,且NtabNAC004、NtabNAC087和NtabNAC175表达量变化最为明显.[结论]NtabNAC004、NtabNAC087和NtabNAC175参与了烟草植株的逆境胁迫调控,研究结果有助于烟草抗逆调控网络解析和后续抗逆育种.
文献关键词：
普通烟草;NAC基因家族;转录因子;系统发育;表达模式;非生物胁迫
中图分类号：
作者姓名：
余世洲;杨志晓;余婧;宋时浩;张孝廉;赵会纳;张长云;林英超;雷波
作者机构：
贵州省烟草科学研究院,烟草行业分子遗传重点实验室,贵阳市观山湖区龙滩坝路29号 550081;青岛颐中科技有限公司,青岛市市北区沾化路3号甲 266011
文献出处：
引用格式：
[1]余世洲;杨志晓;余婧;宋时浩;张孝廉;赵会纳;张长云;林英超;雷波-.普通烟草NAC转录因子家族抗逆基因筛选与表达分析)[J].中国烟草学报,2022(02):111-121
A类：
CUS2,TobEA,AtNAC3,NtabNAC,NtabNAC190,NtabNAC004,NtabNAC087,NtabNAC175
B类：
普通烟草,抗逆,基因筛选,表达分析,NAM,ATAF,发育调控,逆境胁迫应答,烟草品种,K326,拟南芥,同源比对,功能域,利用生物,生物信息学软件,进化关系,表达谱,谱数据,组织表达模式,qRT,测候,冷害,ABA,亲水性,细胞核,系统进化分析,家族基因,不同组织,达特,基因表达量,植株,胁迫调控,调控网络,育种,基因家族,系统发育,非生物胁迫
AB值：
0.252657
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