典型文献
铁皮石斛羟基肉桂酰基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析
文献摘要：
[目的] 对铁皮石斛HCT(Hydroxycinnamoyl transferase)基因家族进行特征鉴定和表达模式分析,为研究铁皮石斛黄酮类化合物和石斛酚的生物合成奠定研究基础.[方法] 通过NCBI在线网站获得铁皮石斛的基因数据信息,利用生物信息学方法分析铁皮石斛DoHCT基因家族成员系统进化树、DoHCTs保守基序和保守结构域,并且预测DoHCT家族成员的蛋白二级和三级结构;同时利用逆转录PCR的方法分析DoHCTs在不同胁迫条件下以及在根茎叶中的差异表达情况.[结果] 铁皮石斛DoHCTs共有8个家族成员(DoHCT 1～8),保守结构域分析结果显示:DoHCT7～8属于转移酶超家族,DoHCT 1～6属于PLN02481超家族.该家族基因的表达可受到非生物胁迫不同程度的影响,其中高温条件下DoHCT家族基因均下调表达;组织表达检测结果显示除DoHCT7外,其余基因均在根茎叶中差异表达.[结论] 在全基因组水平对DoHCT家族进行了系统的生物信息学分析,显示DoHCTs在不同胁迫下以及铁皮石斛根茎叶中存在差异表达,证实其在非生物胁迫应答中起到调控作用.
文献关键词：
铁皮石斛;羟基肉桂酰基转移酶;表达分析;黄酮类化合物;石斛酚
中图分类号：
作者姓名：
龙小琴;聂聪;何基泽;田野;李昕燃;皮鑫瑶;王万军;朱乾坤
作者机构：
西南交通大学生命科学与工程学院,四川 成都 610031
文献出处：
引用格式：
[1]龙小琴;聂聪;何基泽;田野;李昕燃;皮鑫瑶;王万军;朱乾坤-.铁皮石斛羟基肉桂酰基转移酶基因家族生物信息学及其表达分析)[J].福建农业学报,2022(04):492-502
A类：
羟基肉桂酰基转移酶,Hydroxycinnamoyl,铁皮石斛黄酮,DoHCT,DoHCTs,DoHCT7,PLN02481
B类：
酶基因,基因家族,表达分析,transferase,特征鉴定,表达模式分析,黄酮类化合物,石斛酚,生物合成,NCBI,线网,基因数据,利用生物,生物信息学方法,成员系统,系统进化树,保守基序,保守结构域,三级结构,逆转录,胁迫条件,根茎叶,差异表达,超家族,家族基因,可受,非生物胁迫,中高温,高温条件,组织表达,全基因组,生物信息学分析,胁迫应答
AB值：
0.190658
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