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辣椒FLA基因家族的生物信息学分析
文献摘要：
类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)广泛存在于植物中,在植物生长发育的各个阶段起重要作用.为全面了解辣椒FLA基因家族成员,利用生物信息学分析方法对其理化性质、亚细胞定位、系统发育树、染色体定位、基因结构、保守基序及顺式作用元件等进行分析.结果表明:在辣椒基因组数据中共鉴定到25个辣椒FLAs基因家族成员,不均匀地分布于9条染色体上,并分为3个亚族;大多数辣椒FLA基因家族成员编码的蛋白以酸性为主,并定位在细胞膜上;该家族成员在启动子序列中含有多种激素响应、逆境胁迫响应、光响应等和植物生长发育相关的顺式作用元件.
文献关键词：
辣椒;类成束阿拉伯半乳糖蛋白;基因家族;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
李彤;杨晶晶
作者机构：
兰州财经大学农林经济管理学院,甘肃兰州 730101;甘肃农业大学园艺学院,甘肃兰州 730070
文献出处：
引用格式：
[1]李彤;杨晶晶-.辣椒FLA基因家族的生物信息学分析)[J].中国蔬菜,2022(05):29-36
A类：
类成束阿拉伯半乳糖蛋白,fasciclin
B类：
辣椒,基因家族,生物信息学分析,like,arabinogalactan,proteins,FLAs,植物生长发育,各个阶段,利用生物,亚细胞定位,系统发育树,染色体定位,基因结构,保守基序,顺式作用元件,基因组数据,细胞膜,启动子序列,激素响应,逆境胁迫响应,光响应
AB值：
0.227854
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