典型文献
广东地区1株猪非典型瘟病毒的鉴定及遗传演化分析
文献摘要：
猪非典型瘟病毒(atypical porcine pestivirus,APPV)是引起仔猪先天性震颤(congenital tremor,CT)的主要病原,给养猪业带来严重的经济损失.为了解APPV在广东地区猪群的流行和变异情况,本研究于2018-2019年从广东地区采集12份疑似CT的病料样品,通过RT-PCR对APPV进行检测,并对APPV阳性的病料样品通过PCR扩增其全长基因组序列并测序,同时对其ORF和E2基因的同源性、遗传进化关系及E2蛋白氨基酸分子特征进行分析.结果显示,有3份样品为APPV阳性,进一步对其中1份阳性样品通过全基因组PCR扩增得到1条长度为10 989 bp 的 APPV 全长序列,命名为 APPV-China/GD-ZK/2018(GD-ZK).GD-ZK 与参考毒株ORF 和 E2 基因的核苷酸同源性分别为80.7％～99.7％,80.8％～99.9％,其中与APPV/CNYJ/2018的同源性最高.分别对GD-ZK株的ORF和E2基因进行遗传演化分析,结果显示,根据遗传进化关系可将APPV划分为Genotype 1、Genotype 2和Genotype 3三种基因型,而本研究中鉴定到的GD-ZK株属于Genotype 2,与APPV/CNYJ/2018的进化关系最近.分子特征分析结果显示GD-ZK株E2蛋白发生了 S54T和S130T 2个特征性的氨基酸位点突变,且该突变均存在于Genotype 2.因此这2个氨基酸位点突变可作为APPV基因分型潜在的分子标记.本研究初步揭示了 APPV在广东地区猪群中的遗传变异情况,为掌握APPV在广东地区的流行本底奠定了基础.
文献关键词：
APPV;仔猪先天性震颤;遗传演化;变异
中图分类号：
作者姓名：
侯展鹏;陈文俊;林佩仪;梁宇;刘文俊;曹楠;许丹宁;田允波;黄运茂;付新亮
作者机构：
仲恺农业工程学院动物科技学院,广东广州510225;广东省水禽健康养殖重点实验室,广东广州 510225
文献出处：
引用格式：
[1]侯展鹏;陈文俊;林佩仪;梁宇;刘文俊;曹楠;许丹宁;田允波;黄运茂;付新亮-.广东地区1株猪非典型瘟病毒的鉴定及遗传演化分析)[J].中国兽医学报,2022(11):2145-2151,2157
A类：
猪非典型瘟病毒,pestivirus,APPV,仔猪先天性震颤,CNYJ,S54T,S130T
B类：
广东地区,遗传演化分析,atypical,porcine,congenital,tremor,主要病原,给养,养猪业,猪群,变异情况,全长,基因组序列,ORF,E2,同源性,遗传进化,进化关系,分子特征,全基因组,bp,China,GD,ZK,毒株,Genotype,基因型,白发,特征性,氨基酸位点,位点突变,基因分型,分子标记,遗传变异,本底
AB值：
0.194977
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