典型文献
秋茄和桐花树HDACs基因家族鉴定及特征分析
文献摘要：
组蛋白去乙酰化酶(HDACs)能积极响应多种非生物胁迫,为了解红树植物秋茄(Kandelia candel)和桐花树(Aegiceras corniculatum)HDACs基因是否参与非生物胁迫,对秋茄和桐花树进行了HDACs全基因组鉴定和进化分析.结果表明,秋茄和桐花树中分别鉴定出13和11个HDACs家族成员,分为RPD3/HDA1、SIR2和HD2共3个亚家族,每个亚家族都具有相似的基因结构和保守的结构域.染色体定位分析发现,秋茄和桐花树HDACs进化均以纯化选择为主.启动子分析发现,秋茄和桐花树HDACs具有多种类型顺式作用元件,其中以激素和光响应相关的元件为主.对无规则卷曲占比高达65％的HD2亚家族进行序列比对发现,其序列N端都缺少保守五肽基序(MEFWG)保守区域,且多被酸性或碱性氨基酸包围.表达量分析结果表明,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)HD2亚家族聚类紧密的KcHDT2和AcoHDT1基因在根和果实中高表达,而HD2基因多是参与植物调控耐盐、缺氧及抗强光等胁迫过程的基因.综合分析可知,秋茄和桐花树HDACs家族成员在结构及功能上兼具保守性和特异性,HD2亚家族成员在响应非生物胁迫方面具有潜在功能.
文献关键词：
红树植物;秋茄;桐花树;组蛋白去乙酰化酶;全基因组鉴定;系统进化分析;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
肖琳;乐易迅;孙维红;张培兰;邹双全
作者机构：
福建农林大学林学院, 福建 福州350002;自然生物资源保育利用福建省高校工程技术研究中心, 福建 福州350002
文献出处：
引用格式：
[1]肖琳;乐易迅;孙维红;张培兰;邹双全-.秋茄和桐花树HDACs基因家族鉴定及特征分析)[J].森林与环境学报,2022(02):184-192
A类：
RPD3,HDA1,SIR2,MEFWG,KcHDT2,AcoHDT1
B类：
秋茄,桐花树,HDACs,基因家族鉴定,组蛋白去乙酰化酶,积极响应,非生物胁迫,红树植物,Kandelia,candel,Aegiceras,corniculatum,全基因组鉴定,HD2,亚家族,基因结构,结构域,染色体定位,定位分析,启动子分析,多种类型,顺式作用元件,光响应,无规则,卷曲,序列比对,肽基,基序,碱性氨基酸,包围,表达量分析,拟南芥,Arabidopsis,thaliana,耐盐,强光,结构及功能,具保,保守性,系统进化分析
AB值：
0.260872
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