典型文献
杜仲CONSTANS-like全基因组鉴定、系统进化及表达模式分析
文献摘要：
[目的]揭示CONSTANS-like在杜仲Eucommia ulmoides基因组中的分布、结构特征及表达模式.[方法]利用生物信息学方法,对杜仲CONSTANS-like基因家族进行鉴定及理化性质、进化关系、基因结构、启动子元件和表达模式分析.[结果]杜仲基因组中共鉴定到8个EuCOLs基因,分别命名为EuCOL1～EuCOL8,氨基酸数目为315～469,理论等电点分布范围为5.10～6.47,分子量为35.21～52.65 kDa.亚细胞定位预测均定位在细胞核中,为亲水性蛋白,分布于8条染色体.系统进化分为2个亚家族(群组Ⅰ和群组Ⅲ),分别包含2和6个EuCOLs蛋白,同一亚家族基序具有相似性.EuCOLs基因结构简单,启动子中含有多个光周期响应元件.表达模式分析显示:EuCOLs在杜仲叶片发育中表达水平相对较低,EuCOL7在杜仲胶形成中表达量最高,各家族成员表达特征存在差异.蛋白互作预测显示:EuCOL7可与多个光周期响应蛋白互作.[结论]杜仲CONSTANS-like基因家族含有典型的CCT和B-box结构域,可能参与叶片发育及杜仲胶的形成.
文献关键词：
杜仲;CONSTANS-like;生物信息学;表达模式分析
中图分类号：
作者姓名：
刘俊;李龙;陈玉龙;刘燕;吴耀松;任闪闪
作者机构：
河南中医药大学 中医药科学院 河南省中医方证信号传导重点实验室,河南 郑州 450046;国际竹藤中心国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京 100102;国际竹藤中心 安徽太平试验中心,安徽黄山 245700;西北农林科技大学 林学院,陕西 杨凌 712100
文献出处：
引用格式：
[1]刘俊;李龙;陈玉龙;刘燕;吴耀松;任闪闪-.杜仲CONSTANS-like全基因组鉴定、系统进化及表达模式分析)[J].浙江农林大学学报,2022(03):475-485
A类：
EuCOLs,EuCOL1,EuCOL8,EuCOL7
B类：
CONSTANS,like,全基因组鉴定,系统进化,表达模式分析,Eucommia,ulmoides,利用生物,生物信息学方法,基因家族,进化关系,基因结构,启动子,等电点,分布范围,分子量,kDa,亚细胞定位,定位预测,细胞核,亲水性,亚家族,群组,基序,结构简单,光周期,响应元,杜仲叶片,叶片发育,杜仲胶,各家,表达特征,蛋白互作,CCT,box,结构域
AB值：
0.290305
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