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甲基转移酶样蛋白27是结肠癌预后的生物标志物并与免疫浸润相关
文献摘要：
目的 探讨甲基转移酶样蛋白27(METTL27)在结肠癌中的表达、基因功能、免疫浸润和临床预后意义.方法 运用R语言,通过公共数据库TCGA、GEO、HPA数据库分析33种癌谱METTL27表达水平,并鉴定结肠癌中METTL27的差异基因,通过基因功能注释和富集分析鉴定相关信号通路;应用GSVA中的ssGSEA算法进行免疫浸润分析;Wilcoxon秩和检验(连续变量)、Logistic分析评价METTL27表达与临床病理特征的相关性;Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox回归分析,构建列线图和校准图分析评价METTL27表达与临床预后的相关性.qPCR及Western blot实验验证METTL27在肠癌细胞株以及16例肠癌组织中的表达水平.结果 METTL27在21种肿瘤中显著高表达,结肠癌中METTL27的表达明显高于癌周组织(P<0.001);METTL27进行差异分析,并鉴定了METTL27相关的差异基因,绘制了差异表达正负相关前10基因(P<0.001);通过鉴定了METTL27的差异表达基因,初步对其进行了基因功能注释,发现METTL27在跨膜物质转运以及脂质代谢进程中显著富集,进一步GSEA识别了与之相关的5条信号通路;同时分析了METTL27表达与辅助T细胞、辅助T细胞2型、中央记忆型T细胞呈负相关关系(P<0.001);在临床特征与预后分析中,METTL27 mRNA高表达的患者OS、DSS较差,Cox回归分析显示,METTL27表达是OS的独立预后因素;修改为:在不同肠癌细胞株以及16例肠癌组织样本中,METTL27的mRNA表达水平高于正常细胞及组织(P<0.05);配对的4例肠癌组织蛋白检测也证实这一结果(P<0.001).结论 METTL27在结肠癌中异常高表达,并代表了不良的临床预后;高表达的METTL27显示了更少的T细胞免疫浸润,提示METTL27可能为结肠癌的预后标记物.
文献关键词：
结肠癌;甲基转移酶样蛋白27;免疫浸润;临床预后;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
王康;张军;邓牧文;剧永乐;欧阳满照
作者机构：
南方医科大学顺德医院胃肠外科,广东 佛山 528308
文献出处：
引用格式：
[1]王康;张军;邓牧文;剧永乐;欧阳满照-.甲基转移酶样蛋白27是结肠癌预后的生物标志物并与免疫浸润相关)[J].南方医科大学学报,2022(04):486-497
A类：
METTL27
B类：
甲基转移酶,结肠癌,生物标志物,免疫浸润,临床预后,预后意义,公共数据库,TCGA,GEO,HPA,数据库分析,癌谱,差异基因,基因功能注释,功能注释和富集,富集分析,分析鉴定,GSVA,ssGSEA,Wilcoxon,秩和检验,连续变量,临床病理特征,Kaplan,Meier,Cox,列线图,qPCR,blot,癌细胞,细胞株,癌组织,正负,通过鉴定,差异表达基因,物质转运,脂质代谢,预后分析,OS,DSS,独立预后因素,组织蛋白,蛋白检测,细胞免疫,预后标记物
AB值：
0.232454
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