典型文献
基于生物信息学分析胃癌铁死亡相关基因预后及免疫细胞浸润的临床和功能意义
文献摘要：
目的:采用生物信息学方法寻找胃癌(GC)中有预后价值的差异表达基因(DEGs)和免疫细胞浸润矩阵,并探讨其临床和功能意义.方法:建立基于TCGA GC数据集的10个铁死亡相关基因风险模型,并采用GEO数据集验证其预后预测准确性.利用R软件clusterProfiler包进行功能富集分析.单样本基因集富集分析(ssGSEA)量化16个免疫细胞的浸润水平和13个免疫相关通路活性.结果:根据10基因模型得出的中位风险评分将患者分为高风险组和低风险组.生存分析表明,高风险组和低风险组GC患者总生存率(OS)差异有统计学意义.铁死亡相关风险评分与是GC患者OS的独立预测因子.功能富集分析显示,风险模型与PI3K-Akt信号通路相关.ssGSEA和免疫评分相关性分析指出了高风险组中上调的免疫细胞和免疫相关途径,开发了一个列线图帮助临床医生更好地决策.结论:基于10个铁死亡相关基因的风险模型显示出较好的预后预测性能,为GC提供了一种有希望的治疗策略.
文献关键词：
胃癌;铁死亡;预后;生物信息学;列线图;免疫评分
中图分类号：
作者姓名：
罗连响;陈心铭;郑羽诗;罗辉
作者机构：
广东医科大学海洋医药研究院,湛江524023;广东湛江海洋医药研究院,南方海洋科学与工程广东省实验室(湛江),湛江524023;广东医科大学第一临床医学院,湛江524023
文献出处：
引用格式：
[1]罗连响;陈心铭;郑羽诗;罗辉-.基于生物信息学分析胃癌铁死亡相关基因预后及免疫细胞浸润的临床和功能意义)[J].中国免疫学杂志,2022(10):1237-1244
A类：
预后预测性
B类：
生物信息学分析,胃癌,铁死亡相关基因,免疫细胞浸润,功能意义,生物信息学方法,预后价值,差异表达基因,DEGs,TCGA,风险模型,GEO,数据集验证,预测准确性,clusterProfiler,功能富集分析,单样本,基因集富集分析,ssGSEA,免疫相关,相关通路,风险评分,高风险组,低风险组,生存分析,总生存率,OS,相关风险,预测因子,PI3K,Akt,免疫评分,相关途径,列线图,临床医生,预测性能,治疗策略
AB值：
0.309449
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