典型文献
构建基于凋亡相关基因的膀胱癌预后模型
文献摘要:
目的 细胞凋亡在膀胱癌(BC)发生、发展以及化疗等生物学进程中发挥着重要作用.文中通过分析差异表达的凋亡相关基因(ARGs)以及临床特征,构建预测BC患者预后的模型. 方法 分析肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中161个ARGs,筛选出差异表达基因.通过GO和KEGG分析差异表达ARGs在BC中潜在的分子机制.Cox回归分析ARGs在预后的价值,构建评价患者的以后风险模型.使用Kaplan-Meier(KM)曲线和受试者工作特征(ROC)曲线以确定模型的预后价值. 结果 与正常膀胱组织相比,BC组织中41个差异表达ARGs.GO和KEGG分析发现差异表达ARGs与铂类耐药、细胞凋亡、细胞周期等生物学进程有关,同时也与P53等一些肿瘤发生经典途径调控信号通路相关.多因素Cox回归分析发现4个基因(AIFM3、TAP1、CASP6、EMP1)与BC患者生存和预后密切相关.基于人类蛋白质图谱网站数据库验证指出4个基因在肿瘤组织和癌旁正常组织之间也存在差异性表达,并且与患者预后密切相关.KM分析显示高风险评分组的预后明显差于低风险评分组(P=6.002e-06<0.0001).风险评分与相应的临床变量相结合,构建预测患者生存率的诺模图,预测C指数为0.694,预测1年、3年和5年BC生存率的ROC曲线下面积分别为0.652、0.648和0.684. 结论 基于ARGs的预后模型可以用于BC患者的预后预测.
文献关键词:
膀胱癌;凋亡相关基因;预后;肿瘤基因组图谱数据库
中图分类号:
作者姓名:
张磊;姜经航
作者机构:
448000 荆门,荆门市第二人民医院泌尿外科;448000 荆门,荆门市第二人民医院生殖医学中心
文献出处:
引用格式:
[1]张磊;姜经航-.构建基于凋亡相关基因的膀胱癌预后模型)[J].医学研究与战创伤救治,2022(05):512-518
A类:
CASP6,002e
B类:
凋亡相关基因,膀胱癌预后,预后模型,BC,ARGs,TCGA,出差,差异表达基因,Cox,风险模型,Kaplan,Meier,KM,受试者工作特征,定模,预后价值,铂类耐药,细胞周期,P53,肿瘤发生,经典途径,AIFM3,TAP1,EMP1,类蛋白质,肿瘤组织,癌旁,正常组织,差异性表达,风险评分,低风险,诺模图,预后预测,肿瘤基因组图谱数据库
AB值:
0.290114
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