典型文献
基于TGGA数据库构建肺腺癌自噬相关基因预后风险模型
文献摘要：
目的 基于TCGA数据库,结合人类自噬数据库构建预测肺腺癌患者预后的风险模型,探讨自噬相关基因预后风险模型对肺腺癌患者预后的预测性能及与免疫微环境的相关性.方法 从癌症基因组图谱数据库下载肺腺癌患者临床信息和转录组数据,结合人类自噬数据库筛选出232个自噬相关基因.通过Cox回归分析筛选出4个独立与预后相关的自噬基因,并采用风险评分构建肺腺癌预后预测模型,用ROC曲线评价预测模型性能.使用ESTIMATE和CIBERSORT在线网站()探索风险评分与肿瘤免疫微环境之间的关系.结果 肺腺癌中有30个差异表达的自噬相关基因,其中4个自噬基因(BIRC5、ERO1A、ITGB4、NLRC4)具有预测患者预后的功能.依据风险评分进行分组,Kaplan-Meier分析表明高风险组生存率低于低风险组(P<0.0001).ROC曲线表明风险评分模型判断肺腺癌预后的准确性(AUC=0.757).ESTIMATE和CIBERSORT分析提示风险评分模型与肿瘤微环境中的多个免疫细胞亚群浸润相关.结论 自噬相关基因预后风险模型较临床数据能更好地预测肺腺癌患者预后.在高风险组中,CD4+记忆静止细胞可改善肺腺癌患者预后.
文献关键词：
肺腺癌;自噬;免疫细胞;免疫浸润;生存预后
中图分类号：
作者姓名：
王雪芹;刘亚锋;吴静;周家伟;邢应如;张鑫;李丹婷;谢军;丁选胜;胡东
作者机构：
安徽理工大学医学院免疫教研室, 淮南 232000;安徽省职业健康安全工程实验室,淮南 232000;安徽理工大学工业粉尘防控与职业安全健康教育部重点实验室,淮南 232000;安徽理工大学附属肿瘤医院,淮南 232000
文献出处：
引用格式：
[1]王雪芹;刘亚锋;吴静;周家伟;邢应如;张鑫;李丹婷;谢军;丁选胜;胡东-.基于TGGA数据库构建肺腺癌自噬相关基因预后风险模型)[J].安徽医科大学学报,2022(04):528-533
A类：
B类：
TGGA,数据库构建,自噬相关基因,预后风险模型,TCGA,肺腺癌患者,预测性能,癌症基因组图谱数据库,下载,临床信息,转录组数据,Cox,自噬基因,预后预测模型,评价预测,模型性能,ESTIMATE,CIBERSORT,线网,肿瘤免疫微环境,差异表达,BIRC5,ERO1A,ITGB4,NLRC4,Kaplan,Meier,高风险组,低风险组,风险评分模型,肿瘤微环境,免疫细胞亚群,临床数据,CD4+,静止,免疫浸润,生存预后
AB值：
0.283801
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
