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毛竹磷转运蛋白Ⅰ家族基因鉴定及表达模式
文献摘要：
[目的]鉴定毛竹Phyllostachys edulis磷转运蛋白Ⅰ(phosphate transporter 1,PHTⅠ)家族基因,分析其表达模式.[方法]利用生物信息学方法,鉴定毛竹PHTⅠ家族成员,分析基因启动子调控元件、编码蛋白的理化性质、基因结构、氨基酸保守基序、基因在染色体的位置、组织表达特异性、基因适应性进化及系统进化等.[结果]毛竹中共鉴定出20个PHTⅠ家族基因(PePHTs),分布在10条染色体上,均定位于细胞膜.每个基因都含有1～2个内含子,PePHTs启动子序列中包含干旱、低温等非生物胁迫以及赤霉素等激素类响应元件.毛竹PHTⅠ大部分为碱性蛋白质,分子量为48.61～76.37 kDa,理论等电点为6.84～9.30,疏水性值均大于0,都属于疏水蛋白.基因适应性进化分析显示:大多数PePHTs的选择压力值小于0,说明多数基因受到负选择压力.转录组表达图谱表明:PePHTs在不同组织中的表达存在差异性,说明该基因家族在毛竹生长发育过程中发挥着不同的作用.系统进化树表明:PePHTs都聚类在第Ⅰ亚家族,并且优先和水稻Oryza sativa聚类在同一支上.[结论]PHTⅠ家族在植物吸收和转运磷的过程中扮演了重要作用.本研究结果为深入研究毛竹PHTⅠ家族基因的功能奠定了理论基础.
文献关键词：
毛竹;磷转运蛋白;磷吸收;分子特征;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
王绍良;张雯宇;高志民;周明兵;杨克彬;宋新章
作者机构：
浙江农林大学 省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,浙江 杭州 311300;国际竹藤中心 竹藤资源基因科学与基因产业化研究所 国家林业和草原局竹藤科学与技术重点开放实验室,北京 100102
文献出处：
引用格式：
[1]王绍良;张雯宇;高志民;周明兵;杨克彬;宋新章-.毛竹磷转运蛋白Ⅰ家族基因鉴定及表达模式)[J].浙江农林大学学报,2022(03):486-494
A类：
PePHTs
B类：
毛竹,磷转运蛋白,家族基因,基因鉴定,表达模式,Phyllostachys,edulis,phosphate,transporter,利用生物,生物信息学方法,基因启动子,编码蛋白,基因结构,保守基序,组织表达,达特,适应性进化,细胞膜,内含子,启动子序列,非生物胁迫,赤霉素,激素类,响应元,分子量,kDa,等电点,疏水性,疏水蛋白,进化分析,选择压力,压力值,转录组,谱表,不同组织,基因家族,系统进化树,亚家族,水稻,Oryza,sativa,植物吸收,吸收和转运,磷吸收,分子特征,表达分析
AB值：
0.344043
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