典型文献
鸡(土从)菌基因组测序和比较基因组分析
文献摘要：
对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡(土从)菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记开发和PCR扩增验证的研究工作.结果表明:鸡(土从)菌全基因组共存在1.71×103个蛋白质编码基因,平均长度为1.65×103bp;CAZy功能注释聚类分析表明,黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)、面包酵母(Saccharomyces cerevisiae)和裂体吸虫(Schistosoma mansoni)聚类到同一大组,鸡(土从)菌与其他物种聚类到另一大组,且与刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)和糙皮侧耳(P.ostreatus)聚类到更小分组;进化树分析表明,蚁巢伞属真菌与常见的栽培食用菌之间存在一定的进化距离,与金针菇(Flammulina velutipes)、猴头菌(Hericium erinaceus)和香菇(Lentinula edodes)的进化距离较近;采用SSR标记对收集的鸡(土从)菌进行分析,发现一地域分布的鸡(土从)菌在遗传上存在较高的相似性.
文献关键词：
鸡(土从)菌;白蚁;基因组组装;比较基因组;简单重复序列
中图分类号：
作者姓名：
黎勇;孙明伟;杜婉婷;邓佳;陈慧;史典义
作者机构：
内江师范学院生命科学学院,四川内江641100;沱江流域特色农业资源四川省科技资源共享服务平台,四川内江641100
文献出处：
引用格式：
[1]黎勇;孙明伟;杜婉婷;邓佳;陈慧;史典义-.鸡(土从)菌基因组测序和比较基因组分析)[J].食用菌学报,2022(06):1-13
A类：
albuminosus,103bp,Zootermopsis,nevadensis,mansoni
B类：
基因组测序,比较基因组分析,内江市,东兴区,高桥,灌木林,Termitomyces,基因功能注释,碳水化合物酶,carbohydrate,active,enzyme,CAZy,进化树构建,序列比对,简单重复序列,simple,sequence,repeat,SSR,分子标记开发,全基因组,蛋白质编码基因,平均长度,黑腹果蝇,Drosophila,melanogaster,内华达,白蚁,面包酵母,Saccharomyces,cerevisiae,吸虫,Schistosoma,刺芹侧耳,Pleurotus,eryngii,糙皮侧耳,ostreatus,进化树分析,蚁巢,食用菌,进化距离,金针菇,Flammulina,velutipes,猴头菌,Hericium,erinaceus,香菇,Lentinula,edodes,地域分布,传上,基因组组装
AB值：
0.49241
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