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典型文献
栽培种花生LEA蛋白基因家族的鉴定及其低温胁迫下表达分析
文献摘要:
胚胎发育晚期富集蛋白(LEA)在植物胚胎发育过程和抵御非生物胁迫中起重要作用.为了探索栽培种花生LEA蛋白家族基因(AhLEA)的结构和功能,利用生物信息学方法对AhLEA基因家族成员进行全基因组鉴定,并对其种子发育不同时期和低温胁迫下的表达特性进行分析.结果表明:在栽培种花生中共鉴定到118个AhLEA基因,根据其保守结构域和进化关系分为八个亚家族,LEA_2亚家族成员最多;大多数AhLEA蛋白是亲水的,定位于细胞核、叶绿体和细胞膜;87%AhLEA基因具有较少的内含子(<3),并且在所有20条染色体上分布不均.转录组数据显示,在低温胁迫(2℃)条件下,45个AhLEA基因表达发生变化,其中,28个基因表达量升高,17个基因表达量降低.对表达显著上调的9个AhLEA基因进行qRT-PCR验证,其表达趋势与转录组结果相一致.在种子发育过程中表达量升高的16个基因及表达量降低的2个基因,在低温胁迫条件下表达量均显著增加,预示着这18个AhLEA基因在调控花生种子发育及对低温胁迫的响应中可能发挥着重要作用,为进一步研究AhLEA基因在花生种子萌发期抵抗低温胁迫中的作用提供了基础数据.
文献关键词:
栽培种花生;LEA基因家族;全基因组鉴定;低温胁迫;表达分析
作者姓名:
付娆;李佳佳;单燕;张海洋;衣葵花;修妤;梁晓艳;张佳蕾
作者机构:
山东省蚕业研究所,山东 烟台 264002;山东省农业科学院农作物种质资源研究所,山东 济南 250100
文献出处:
引用格式:
[1]付娆;李佳佳;单燕;张海洋;衣葵花;修妤;梁晓艳;张佳蕾-.栽培种花生LEA蛋白基因家族的鉴定及其低温胁迫下表达分析)[J].花生学报,2022(03):1-12
A类:
AhLEA
B类:
栽培种花生,基因家族,低温胁迫,表达分析,胚胎发育,非生物胁迫,白家,家族基因,结构和功能,利用生物,生物信息学方法,全基因组鉴定,种子发育,表达特性,保守结构域,进化关系,八个,亚家族,亲水,细胞核,叶绿体,细胞膜,内含子,转录组数据,基因表达量,qRT,相一致,胁迫条件,预示,控花,花生种子,种子萌发期,抗低温
AB值:
0.214716
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