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典型文献
花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因家族生物信息学分析
文献摘要:
氮素利用效率(nitrogen utilization efficiency,NUE)是影响花生产量的重要因素之一.基于前期产量相关性状全基因组关联分析锚定到的一个候选基因,属于花生高亲和硝酸盐转运蛋白(nitrate transporter 2,NRT2)基因家族.本研究利用栽培种花生全基因组和不同组织的转录组信息,对NRT2家族成员进行了全基因组鉴定与表达模式分析.共鉴定到10个NRT2基因家族成员,染色体定位分析结果显示这些基因不均匀地分布在20条染色体上.其中,3号(AhNRT2.5c)和13号(AhNRT2.5b)染色体,6号(AhNRT2.7b)和16号(AhNRT2.7a)染色体上的基因成员存在同源关系.AhNRT2.4,AhNRT2.5a,AhNRT2.5b和AhNRT2.5c四个基因在根组织中表达量较高,表明这些NRT2基因在根系中发挥重要作用.该结果为进一步研究花生NRT2基因家族及在氮转运过程中的作用机制提供了理论依据.
文献关键词:
栽培种花生;高亲和硝酸转运蛋白;基因功能鉴定;表达模式分析
作者姓名:
王娟;石大川;陈皓宁;吴丽青;闫彩霞;陈静;赵小波;孙全喜;苑翠玲;牟艺菲;单世华;李春娟
作者机构:
山东省花生研究所,山东青岛,266100;山东省青岛市农业科学研究院,山东青岛,266100;中国海洋大学食品科学与工程学院,山东青岛,266000;山东省菏泽市农业科学研究院,山东青岛,274000
引用格式:
[1]王娟;石大川;陈皓宁;吴丽青;闫彩霞;陈静;赵小波;孙全喜;苑翠玲;牟艺菲;单世华;李春娟-.花生高亲和硝酸盐转运蛋白基因家族生物信息学分析)[J].中国油料作物学报,2022(02):316-323
A类:
AhNRT2,高亲和硝酸转运蛋白
B类:
硝酸盐转运蛋白基因,基因家族,生物信息学分析,氮素利用效率,nitrogen,utilization,efficiency,NUE,花生产量,前期产量,产量相关性状,全基因组关联分析,锚定,候选基因,nitrate,transporter,研究利用,栽培种花生,不同组织,转录组,全基因组鉴定,表达模式分析,染色体定位,定位分析,5c,5b,7b,7a,5a,根组织,组织中表达,根系,氮转运,基因功能鉴定
AB值:
0.279952
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