典型文献
陆地棉GhERL1基因的鉴定及生物信息学分析
文献摘要：
棉花是我国重要的经济作物,其生长发育过程中易受非生物胁迫和病菌危害.而ERL1基因是植物体内重要的信号转导因子,其在植物抗逆和生长发育过程中有重要作用.通过分析不同胁迫模式下陆地棉ERL1基因的表达特征,了解其在逆境胁迫中具有的功能,以期为分子育种创新种质提供基因资源.本研究以ERECTA家族成员中的ERL1为研究目标,采用生物信息学方法分析陆地棉GhERL1的理化性质、蛋白质结构、亚细胞定位建模、基因的组织特异性表达和蛋白互作调控网络.生物信息学分析表明陆地棉GhERL1含有998个氨基酸残基,理论等电点为5.76,具有典型的LRR富集区,属于稳定蛋白.蛋白质二级结构以α螺旋和无规卷曲为主,亚细胞定位预测GhERL1分布在细胞膜.GhERL1在子叶、纤维、胚珠、根、茎和叶组织均有表达,在根和茎组织的表达量高于其他组织.在不同时间的冷胁迫、热胁迫、干旱胁迫和盐胁迫下,GhERL1基因的表达存在差异性.而在蛋白互作调控网络中,GhERL1和参与气孔发育、生物信号传递、细胞周期调控相关的蛋白构成共表达网络.陆地棉GhERL1的鉴定及不同胁迫模式下的表达分析为棉花生长发育过程中的非生物胁迫研究提供了重要的线索.
文献关键词：
陆地棉;ERL1;胁迫;表达分析;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
刘文豪;孔宪辉;王旭文;司爱君;马麒;赵福相;余渝
作者机构：
新疆农垦科学院棉花研究所/农业农村部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室,新疆 石河子 832000
文献出处：
引用格式：
[1]刘文豪;孔宪辉;王旭文;司爱君;马麒;赵福相;余渝-.陆地棉GhERL1基因的鉴定及生物信息学分析)[J].绿洲农业科学与工程,2022(02):15-20
A类：
GhERL1,ERL1,ERECTA
B类：
陆地棉,生物信息学分析,经济作物,中易,非生物胁迫,植物体,信号转导,抗逆,表达特征,逆境胁迫,分子育种,育种创新,创新种质,基因资源,生物信息学方法,蛋白质结构,亚细胞定位,组织特异性,特异性表达,蛋白互作,调控网络,氨基酸残基,等电点,LRR,富集区,蛋白质二级结构,无规,卷曲,定位预测,细胞膜,子叶,胚珠,他组织,冷胁迫,热胁迫,干旱胁迫,盐胁迫,气孔发育,信号传递,细胞周期,周期调控,共表达网络,表达分析,棉花生长发育
AB值：
0.301638
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