典型文献
棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
文献摘要:
[目的]短链相关序列(SHI-related sequence,SRS)家族是一类植物特有的转录因子,在调节植物生长发育和逆境胁迫反应中发挥重要作用.鉴定和分析棉花SRS基因家族成员.[方法]结合拟南芥相关信息,以陆地棉和海岛棉为主要研究对象,对棉花SRS基因进行全基因组鉴定和系统进化研究,并分析其在不同器官、不同发育时期的胚珠和纤维、以及在非生物胁迫下棉苗中的表达模式.[结果]在陆地棉和海岛棉中分别鉴定出27个和26个SRS基因,系统进化分析将棉花SRS基因家族成员划分为3个分支,不同分支都具有相似的保守基序.每个分支都存在多对同源基因.一些SRS基因在胚珠发育时期表达量较高,并响应多种非生物胁迫.[结论]分析预测了棉花SRS基因的家族成员进化关系与潜在功能,为棉花SRS基因的功能研究提供初步的理论基础.
文献关键词:
棉花;SRS;系统进化;表达模式;基因家族
中图分类号:
作者姓名:
张雪;孙瑞斌;马聪聪;马丹;张晓睿;刘志红;刘传亮
作者机构:
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室,河南安阳,455000
文献出处:
引用格式:
[1]张雪;孙瑞斌;马聪聪;马丹;张晓睿;刘志红;刘传亮-.棉花SRS基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析)[J].棉花学报,2022(02):107-119
A类:
B类:
棉花,SRS,基因家族,全基因组鉴定,生物信息学分析,相关序列,SHI,related,sequence,植物生长发育,逆境胁迫,胁迫反应,拟南芥,陆地棉,海岛棉,不同器官,不同发育时期,胚珠,非生物胁迫,表达模式,系统进化分析,保守基序,同源基因,分析预测,进化关系,功能研究
AB值:
0.292085
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