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典型文献
陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证
文献摘要:
为研究棉花重金属结构域基因GhPKE1在棉花中的作用,采用生物信息学方法对GhPKE1 DNA序列的结构特性及其编码蛋白质的理化性质、疏水性和蛋白二级结构等进行分析,并根据GhPKE1的结构特点构建了GhPKE1的病毒诱导基因沉默(VIGS)载体侵染棉花.结果 表明,GhPKE1基因序列全长1048 bp,蛋白质相对分子质量27.54 kD,等电点9.3,不稳定系数35.56.分别用硫酸钠(Na2SO4)和氯化镉(CdCl2)胁迫处理沉默GhPKE1的三叶期棉苗,处理后植株表现出明显的表型差异.qRT-PCR表达模式分析表明,用pYL156:GhPKE1侵染过的棉花中GhPKE1转录水平与对照相比显著降低;与对照相比,沉默GhPKE1棉花幼苗的抗Na2SO4和抗CdCl2性显著减弱.综上所述,GhPKE1基因在棉花响应逆境胁迫过程中发挥重要作用,为进一步研究棉花的抗逆机制奠定基础.
文献关键词:
陆地棉;GhPKE1;生物信息学分析;VIGS
作者姓名:
王琴琴;陈修贵;陆许可;王帅;张悦新;范亚朋;陈全家;叶武威
作者机构:
新疆农业大学农学院,教育部棉花工程研究中心,乌鲁木齐830052;中国农业科学院棉花研究所,棉花生物学国家重点实验室,河南安阳455000
引用格式:
[1]王琴琴;陈修贵;陆许可;王帅;张悦新;范亚朋;陈全家;叶武威-.陆地棉GhPKE1的生物信息学分析及功能验证)[J].中国农业科技导报,2022(01):38-45
A类:
GhPKE1,pYL156
B类:
陆地棉,生物信息学分析,功能验证,金属结构,结构域,生物信息学方法,结构特性,编码蛋白,疏水性,蛋白二级结构,病毒诱导基因沉默,VIGS,侵染,基因序列,全长,bp,相对分子质量,kD,等电点,不稳定系数,硫酸钠,Na2SO4,氯化镉,CdCl2,胁迫处理,三叶期,植株,表型差异,qRT,表达模式分析,转录水平,棉花幼苗,综上所述,逆境胁迫,抗逆
AB值:
0.317543
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