典型文献
陆地棉ACX基因家族的鉴定与功能分析
文献摘要：
[目的]通过对陆地棉酰基辅酶A氧化酶(acyl coenzyme A oxidase,ACX)基因家族进行鉴定和表达分析,为后续研究ACX基因的功能奠定基础.[方法]采用生物信息学方法对陆地棉基因组中ACX基因家族成员进行鉴定,并系统分析其理化性质、基因结构、进化关系、基因复制、启动子区顺式作用元件和表达模式等.利用病毒诱导的基因沉默技术初步探究GhACX16基因的功能.[结果]陆地棉基因组中鉴定到20个ACX基因,分布在13条染色体上,聚类分析将其分为4个亚族.非同义突变率/同义突变率(Ka/Ks)分析结果表明陆地棉ACX家族基因经历了较强烈的纯化选择.ACX基因的启动子区含有热应激、干旱、植物激素响应等相关的顺式作用元件.非生物胁迫下的表达模式分析结果显示,陆地棉ACX基因明显响应高温、低温、盐和模拟干旱胁迫;分析高温胁迫下耐高温与高温敏感棉花材料不同发育时期的花药中ACX基因的表达模式,发现GhACX5和GhACX16基因的表达量变化明显.与阴性对照相比,高温胁迫下GhACX16基因沉默的棉苗表现出明显的耐高温特征,且叶片中脯氨酸含量、叶绿素含量和过氧化氢酶活性显著升高,而丙二醛含量显著降低.[结论]陆地棉ACX基因的鉴定及表达模式分析表明,ACX基因广泛参与非生物胁迫响应;经基因沉默试验和生理生化分析初步推测其中的GhACX16基因可能在高温胁迫响应中发挥重要的功能.
文献关键词：
陆地棉;ACX基因;生物信息学;表达模式分析;GhACX16;病毒诱导的基因沉默
中图分类号：
作者姓名：
田一波;潘奥;陈劲;周仲华;袁小玲;刘志
作者机构：
湖南农业大学生物科学技术学院,长沙410128
文献出处：
引用格式：
[1]田一波;潘奥;陈劲;周仲华;袁小玲;刘志-.陆地棉ACX基因家族的鉴定与功能分析)[J].棉花学报,2022(03):215-226
A类：
ACX,GhACX16,GhACX5
B类：
基因家族,功能分析,酰基,基辅,辅酶,acyl,coenzyme,oxidase,表达分析,生物信息学方法,陆地棉基因组,基因结构,进化关系,基因复制,启动子区,顺式作用元件,病毒诱导的基因沉默,非同,同义突变,突变率,Ka,Ks,家族基因,热应激,植物激素,激素响应,非生物胁迫,表达模式分析,因明,干旱胁迫,耐高温,高温敏感,棉花,不同发育时期,花药,高温特征,脯氨酸含量,叶绿素含量,过氧化氢酶活性,丙二醛含量,生理生化,生化分析,高温胁迫响应
AB值：
0.228862
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