典型文献
拟南芥START结构域亚家族生物信息学分析及功能
文献摘要：
START(The Steroidogenic Acute Regulatory Protein-related Lipid Transfer)结构域广泛存在于动物和植物中,参与脂质分子的转移,发挥多种生物学功能.为明确拟南芥S TA RT结构域家族成员的结构特征及功能机制,本研究以拟南芥S TA RT结构域亚家族为研究对象,通过生物信息学对该家族成员的进化关系、理化性质、基因结构、启动子顺式作用元件进行分析比较,在此基础上,通过qRT-PCR技术,对仅含START结构域亚家族成员在拟南芥发育不同组织表达特性进行了分析,通过分析仅含S TA RT结构域亚家族成员的功能获得和功能缺失的转基因拟南芥幼苗形态,确定该亚家族成员对拟南芥幼苗生长的调控作用.结果发现,拟南芥S TA RT结构域家族共有35个成员,仅含START结构域亚家族9个成员,但在进化树分析中At4g26920和At5g07260与其余7个成员不在同一分枝中,且其疏水性结合位点不同.仅含START结构域亚家族成员中仅有At3g23080不稳定系数小于40,较为稳定,多数成员均为不稳定蛋白质.基因表达分析表明仅含START结构域亚家族成员具有明显的组织特异表达特性,参与调控幼苗生长发育,为深入探究S TA RT结构域调控植物生长发育的生物学功能和作用机制奠定了基础.
文献关键词：
拟南芥;START结构域;生物信息学分析;生长发育
中图分类号：
作者姓名：
李晓凯;刘霞;常红娟;王凤茹
作者机构：
河北省植物生理与分子病理学重点实验室/河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室,河北 保定 071000
文献出处：
引用格式：
[1]李晓凯;刘霞;常红娟;王凤茹-.拟南芥START结构域亚家族生物信息学分析及功能)[J].河北农业大学学报,2022(02):76-85
A类：
Steroidogenic,At4g26920,At5g07260,At3g23080
B类：
START,结构域,亚家族,生物信息学分析,Acute,Regulatory,Protein,related,Lipid,Transfer,脂质分子,生物学功能,功能机制,进化关系,基因结构,启动子,顺式作用元件,qRT,不同组织,组织表达特性,转基因拟南芥,进化树分析,分枝,疏水性,结合位点,不稳定系数,数成,基因表达分析,特异表达,幼苗生长发育,植物生长发育
AB值：
0.245137
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