典型文献
云南拉市海高原湿地H9N2亚型禽流感病毒的遗传特性分析
文献摘要：
为了解禽流感病毒(AIV)在野禽和家禽之间的传播特点,本研究于2020年3月～2021年3月在野生鸟类资源丰富的拉市海国际高原湿地采集到野鸟粪便样品1367份、家禽泄殖腔拭子420份和环境水样20份,共计1807份样品,通过鸡胚接种和RT-PCR分离鉴定出1株斑头雁来源的H9N2 AIV和2株家禽来源的H9N2 AIV.利用Illumina Miseq测序平台获得3株分离病毒的全基因组序列,并构建了其遗传进化树,分析了与流感病毒的传播能力及致病力相关的关键氨基酸位点的特征.遗传进化分析结果显示,野禽源和家禽源AIV具有相同的遗传进化特征:3株H9N2 AIV均属于欧亚谱系h9.4.2.5分支的病毒,其HA、NA基因为Y280-like亚群,PB2、M基因为G1-like亚群,PB1、PA、NP和NS基因为F/98-like亚群,推测3株分离株均为重组病毒,重组模式为中国流行的H9N2 AIV S基因型.氨基酸位点分析结果显示,3株分离病毒HA、NA、PB2、PB1、M1和NS1蛋白的突变位点均与病毒跨种属传播能力和小鼠致病力增强相关;同时野禽源H9N2 AIV同样存在家禽源分离株相似的HA蛋白N166D替换和NA蛋白颈部aa63～aa65位点缺失,但PA蛋白中未发生N383D突变.以上结果表明,本研究中野禽源H9N2 AIV可能源于家禽的传播,病毒在自然宿主野禽中发生了适应性突变.本研究首次对拉市海高原湿地野禽源与家禽源H9N2 AIV的遗传变异特征进行了系统分析,为禽流感的综合防控提供基础数据.
文献关键词：
禽流感病毒;H9N2;遗传进化分析;野鸟
中图分类号：
作者姓名：
季佳;张振兴;薛晓岩;王雯慧;韩联宪;代红炀;李高银;段博芳;张文东;刘强;李素华;宋建领
作者机构：
西南林业大学生命科学学院/国家高原湿地研究中心,云南 昆明 650224;云南省畜牧兽医科学院云南省热带亚热带动物病毒病重点实验室,云南 昆明 650224;会泽黑颈鹤国家级自然保护区管护局,云南 曲靖 654200;昭阳区动物卫生监督所,云南 昭通 657000;云南省动物疾病预防控制中心,云南 昆明 650034
文献出处：
引用格式：
[1]季佳;张振兴;薛晓岩;王雯慧;韩联宪;代红炀;李高银;段博芳;张文东;刘强;李素华;宋建领-.云南拉市海高原湿地H9N2亚型禽流感病毒的遗传特性分析)[J].中国预防兽医学报,2022(03):250-256
A类：
Y280,N166D,aa63,aa65,N383D
B类：
拉市海,高原湿地,H9N2,禽流感病毒,遗传特性,AIV,在野,野禽,家禽,传播特点,野生鸟类,鸟类资源,海国,野鸟,鸟粪,粪便样品,泄殖腔,环境水样,鸡胚,分离鉴定,斑头雁,Illumina,Miseq,测序平台,全基因组序列,遗传进化树,传播能力,致病力,关键氨基酸位点,遗传进化分析,进化特征,欧亚,h9,HA,NA,like,亚群,PB2,G1,PB1,PA,NP,分离株,重组病毒,重组模式,基因型,氨基酸位点分析,M1,NS1,突变位点,种属,增强相,源分离,中野,宿主,遗传变异,变异特征,综合防控
AB值：
0.324907
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