典型文献
基于重测序的41份芝麻种质资源全基因组序列分析
文献摘要：
为揭示贵州不同生态区域芝麻种质全基因组突变类型,通过41份芝麻种质资源的全基因组重测序对单核苷多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)、小片段插入缺失(Insertion-deletion,InDel)和结构变异(Structural Varia-tion,SV)等进行检测并注释,明确各突变在全基因组范围内的突变数量与位置信息,并基于SNP数据对41份芝麻种质资源进行种群结构分析.结果表明,共检测到SNP位点20940797个,InDel位点2989500个,SV位点138135个,其中SI_35材料的SNP、InDel、SV三个变异类型位点数量均为最多,分别为1032613个、144363个、5328个.群体结构分析结果显示,41份芝麻种质资源包含4个亚群;主成分分析结果显示,各芝麻种质在主成分1、主成分2之间的相互距离及位置基本符合进化树和群体机构的分析结果.本研究为贵州芝麻种质资源的研究提供了初步的进化框架.
文献关键词：
芝麻;全基因组重测序;SNP;InDel;SV;群体结构
中图分类号：
作者姓名：
宋成孝;舒中兵;邓宽平;金松;覃成
作者机构：
遵义市农业科学研究院/遵义市作物基因资源与种质创制重点实验室,贵州 遵义 563006;遵义职业技术学院现代农业系,贵州 遵义 563006
文献出处：
引用格式：
[1]宋成孝;舒中兵;邓宽平;金松;覃成-.基于重测序的41份芝麻种质资源全基因组序列分析)[J].种子,2022(05):41-50
A类：
Varia
B类：
芝麻,种质资源,全基因组序列分析,不同生态区,生态区域,基因组突变,全基因组重测序,多态性,Single,Nucleotide,Polymorphism,SNP,小片,插入缺失,Insertion,deletion,InDel,结构变异,Structural,SV,变数,位置信息,种群结构,SI,变异类型,群体结构分析,资源包,亚群,进化树
AB值：
0.313843
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
