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基于重测序的广西姑婆山野生柑橘资源遗传演化及分类地位分析
文献摘要：
对4个广西姑婆山野生柑橘、1个枳、1个金柑以及14个其他柑橘进行全基因组重测序,每个样本测序数据量约为16 Gb,平均测序深度为54×.通过基因组比对、SNP检测、PCA主成分分析、邻接法构建系统发育进化树,分析广西贺州姑婆山野生柑橘资源遗传多样性、群体结构及分类地位.从20份样品中,共检测出6782158个高质量SNP位点.基于这些SNP位点,根据PCA主成分分析和系统进化树分析结果,可将20份样本分为3类:广西姑婆山野柑与莽山野柑聚为一类,金柑与其他柑橘聚为一类,枳聚为单独一类.该研究表明姑婆山野生柑橘资源与莽山野柑一样具有原始性和独特性,应该为独立的属或者柑橘属中独立的种.
文献关键词：
柑橘;基因组;进化;多样性
中图分类号：
作者姓名：
武晓晓;陈传武;刘萍;唐艳;邓崇岭
作者机构：
广西特色作物研究院,广西柑橘育种与栽培工程技术研究中心,广西桂林541004
文献出处：
引用格式：
[1]武晓晓;陈传武;刘萍;唐艳;邓崇岭-.基于重测序的广西姑婆山野生柑橘资源遗传演化及分类地位分析)[J].园艺学报,2022(02):407-415
A类：
B类：
姑婆山,山野,遗传演化,分类地位,金柑,全基因组重测序,序数,数据量,Gb,SNP,邻接,接法,建系,系统发育进化树,广西贺州,遗传多样性,群体结构,系统进化树分析,莽山,独一,原始性,柑橘属
AB值：
0.268331
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