典型文献
甘蔗HTD2基因的表达特征及基因多态性分析
文献摘要：
分蘖是无性繁殖经济作物-甘蔗最重要的农艺性状之一,挖掘分蘖关键基因用于甘蔗理想株型调控是增加品种产量的重要途径.本研究使用实时荧光定量PCR技术对前期从甘蔗中获得的与水稻分蘖关键基因HTD2高度同源的ScHTD2基因开展表达特征分析,然后探讨其在甘蔗种质资源群体中的基因多态性情况,筛选与分蘖性状相关的变异位点.结果显示,该基因表达具有组织特异性,在叶中表达最高;腋芽萌动发育过程中,在休眠芽中表达量最高,随着蔗芽萌动,开始显著下调表达,负调控蔗芽的萌动发育;植物激动素、生长素和独脚金内酯都能显著诱导该基因在萌动蔗芽和蔗苗分蘖芽中的表达,结合激素处理的表型变化特征,预示生长素和独脚金内酯诱导该基因的高表达会抑制萌动蔗芽的继续发育和延迟蔗苗的分蘖,但植物激动素诱导的高表达并没有这种抑制效应.对从26份甘蔗种质资源中获得的520条HTD2基因组DNA克隆序列开展基因多态性分析表明,在基因组结构上,该基因具有2个外显子和1个内含子,其中内含子区域变异最为丰富.从群体基因多态性看,原始种亲本群体在外显子1和2区域表现出较高的核苷酸多样性,而主栽品种群体在内含子区域表现出较高的核苷酸多样性.从编码区单倍型多样性来看,原始种亲本群体间单倍型多样性最为丰富,其次为主栽品种群体.基因选择性测验中,原始种亲本群体受正向选择,选择压力较大,基因进化速度快,而骨干亲本群体和主栽品种群体受负向选择,向纯化方向发展.编码区单倍型演化分析表明,Hap3和Hap4处于单倍型演化的辐射中心,属于较为原始的类型.基因编码区变异位点与分蘖率相关性检测揭示该基因有23个SNP位点和5个InDel位点不同变异类型剂量与甘蔗种质资源分蘖率呈显著相关,变异类型剂量效应将是未来甘蔗分子辅助育种重要的关注点.研究为进一步深入解析甘蔗分蘖调控关键基因的功能作用和开发功能性标记奠定了重要基础.
文献关键词：
甘蔗;HTD2;基因表达;基因多态性;变异位点
中图分类号：
作者姓名：
李旭娟;李纯佳;吴转娣;田春艳;胡鑫;丘立杭;吴建明;刘新龙
作者机构：
云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室,云南开远 661699;广西农业科学院甘蔗研究所/广西甘蔗遗传改良重点实验室,广西南宁 530007
文献出处：
引用格式：
[1]李旭娟;李纯佳;吴转娣;田春艳;胡鑫;丘立杭;吴建明;刘新龙-.甘蔗HTD2基因的表达特征及基因多态性分析)[J].作物学报,2022(07):1601-1613
A类：
HTD2,ScHTD2
B类：
表达特征,基因多态性,多态性分析,无性繁殖,经济作物,农艺性状,关键基因,理想株型,株型调控,水稻,甘蔗种质,种质资源,分蘖性,变异位点,有组织,组织特异性,腋芽,萌动,休眠芽,蔗芽,负调控,激动素,生长素,独脚金内酯,激素处理,预示,继续发育,抑制效应,基因组结构,外显子,内含子区域,亲本群体,核苷酸多样性,主栽品种,品种群,编码区,单倍型多样性,群体间,基因选择,测验,正向选择,选择压力,基因进化,骨干亲本,负向选择,演化分析,Hap3,Hap4,辐射中心,基因编码,率相关性,SNP,InDel,变异类型,剂量效应,分子辅助育种,关注点,功能作用
AB值：
0.275308
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