典型文献
基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用
文献摘要：
选取3份长豇豆种质资源进行全基因组重测序,利用重测序数据挖掘InDel位点,根据这些位点开发分子标记,并验证这些标记的有效性和应用价值.经过严格筛选,获得981个易于凝胶电泳检测的长度大于30 bp且多态性高的InDel位点,挑选其中在基因组上均匀分布的165个设计引物并进行验证.用6份长豇豆材料对165对引物进行初筛,其中162对可获得PCR扩增产物,共扩增出673条条带;85对引物表现出多态性,多态性带333条(占总带数的49.48％).利用85个多态性高的标记对173份长豇豆资源进行基因分型和遗传多样性分析,共检测到333个等位位点;多态性信息含量(PIC)为0.01～0.37,平均值为0.29;基因多样性指数变异范围为0.01～0.50,平均值为0.36,表明现有长豇豆资源遗传背景相对狭窄.通过聚类分析,173份长豇豆被分为2个类群,成功将不同类型长豇豆划分到不同亚群.另外,选用亲本间多态性标记用于6个杂交组合的F1代真实性鉴定,鉴定出5个真实杂交种.本研究所开发的多态性InDel标记在长豇豆遗传多样性分析、杂交种纯度鉴定、遗传连锁图谱构建、基因定位和分子标记辅助选择育种等方面具有很好的应用前景.
文献关键词：
长豇豆;InDel标记;遗传多样性;F1代真实性鉴定
中图分类号：
作者姓名：
杨易;黎庭耀;李国景;陈汉才;沈卓;周轩;吴增祥;吴新义;张艳
作者机构：
广东省农业科学院蔬菜研究所,广东省蔬菜新技术研究重点实验室,广州510640;浙江省农业科学院蔬菜研究所,杭州310021
文献出处：
引用格式：
[1]杨易;黎庭耀;李国景;陈汉才;沈卓;周轩;吴增祥;吴新义;张艳-.基于重测序的长豇豆基因组InDel标记开发及应用)[J].园艺学报,2022(04):778-790
A类：
B类：
长豇豆,InDel,标记开发,开发及应用,豆种,种质资源,全基因组重测序,序数,凝胶电泳,bp,均匀分布,引物,初筛,扩增产物,条条,条带,基因分型,遗传多样性分析,等位,多态性信息含量,PIC,多样性指数,指数变异,遗传背景,类群,分到,亚群,亲本,杂交组合,真实性鉴定,杂交种,纯度鉴定,遗传连锁图谱,图谱构建,基因定位,分子标记辅助选择育种
AB值：
0.270782
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