典型文献
百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析
文献摘要：
[目的]研究AP2/ERF家族成员ERF基因在百合休眠解除过程中的作用.[方法]以百合品种西伯利亚(Lilium oriental'Siberia')的小鳞茎为试验材料,从前期试验获得的转录组测序数据中筛选得到1个在小鳞茎休眠解除过程中显著上调表达的ERF转录因子,结合RT-PCR技术扩增得到西伯利亚小鳞茎的ERF基因cDNA全长序列,命名为LoERF4;通过多种生物信息学软件对LoERF4的基因结构和理化性质等进行分析;利用荧光定量qRT-PCR技术检测LoERF4基因在小鳞茎休眠解除过程中的相对表达量.[结果]通过克隆得到LoERF4基因全长,该基因开放阅读框全长为606 bp,编码201个氨基酸,含有1个典型的保守AP2结构域;蛋白相对分子量约为21.52 ku,理论等电点为6.43,为亲水性蛋白,没有跨膜结构.qRT-PCR分析结果显示:在西伯利亚小鳞茎休眠解除过程中,该基因的表达量在第20天小鳞茎休眠解除、开始萌发时极显著升高.[结论]在百合中克隆得到的LoERF基因可能是参与调控百合小鳞茎休眠解除进程的关键因子之一.
文献关键词：
百合(Lilium spp.);LoERF4;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
王浩;孙亮;张济民;贾文杰;吴雅文;张小平;李想;王有国
作者机构：
云南农业大学园林园艺学院,云南昆明650201;金华职业技术学院农学院,浙江金华321017;云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650205
文献出处：
引用格式：
[1]王浩;孙亮;张济民;贾文杰;吴雅文;张小平;李想;王有国-.百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析)[J].云南农业大学学报（自然科学）,2022(06):1021-1030
A类：
LoERF4,LoERF
B类：
百合,AP2,生物信息学分析,休眠解除,除过,西伯利亚,Lilium,oriental,Siberia,小鳞茎,从前,转录组测序,序数,选得,cDNA,全长,生物信息学软件,基因结构,qRT,相对表达量,开放阅读框,bp,结构域,白相,相对分子量,ku,等电点,亲水性,膜结构,萌发,关键因子,spp,基因克隆
AB值：
0.228739
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