典型文献
甜橙TIFY基因家族的鉴定及其在成花诱导中的表达分析
文献摘要:
为了挖掘甜橙(Citrus sinensis)TIFY基因的功能,本研究从全基因组水平对甜橙TIFY基因家族进行生物信息学分析,并利用qRT-PCR检测其在不同甜橙品种花芽和叶片中的表达特异性.结果显示,甜橙全基因组共含有13个CsTIFY基因,其蛋白质大小为120~373 aa;这些基因分布于甜橙8条染色体上,均具有保守的TIFY结构域;系统发育分析将所有的CsTIFY蛋白聚类成8个亚族,位于同一亚族的CsTIFYs含有相似的基因结构和保守基序;转录组数据分析结果表明,不同组织中CsTIFYs的表达量存在差异,其中Cs-TIFYI、CsTIFY5、CsTIFY6、CsTIFY8、CsTIFY10和CsTIFY11在甜橙花和叶片中的表达量均较高.qRT-PCR检测结果表明,CsTIFYs在成花时间不同的两甜橙品种花芽和叶片中的相对表达水平均出现上调趋势,且采样各时期下早花品种'赣南早'两组织中CsTIFYs的表达量均高于对照品种'纽荷尔',暗示CsTIFYs与甜橙花器发育和成花转变密切相关.研究结果为深入了解CsTIFYs在甜橙成花诱导中的功能提供理论参考.
文献关键词:
甜橙;TIFY基因家族;生物信息学;基因表达;成花诱导
中图分类号:
作者姓名:
杨杰;陈蓉;胡文娟;佟晓楠;李兴涛
作者机构:
赣南师范大学生命科学学院,江西赣州 341000;国家脐橙工程技术研究中心,江西赣州 341000
文献出处:
引用格式:
[1]杨杰;陈蓉;胡文娟;佟晓楠;李兴涛-.甜橙TIFY基因家族的鉴定及其在成花诱导中的表达分析)[J].西北农业学报,2022(07):866-875
A类:
CsTIFY,CsTIFYs,TIFYI,CsTIFY5,CsTIFY6,CsTIFY8,CsTIFY10,CsTIFY11,甜橙花
B类:
基因家族,成花诱导,表达分析,Citrus,sinensis,全基因组,生物信息学分析,qRT,种花,花芽,达特,aa,基因分布,结构域,系统发育分析,基因结构,保守基序,转录组数据,不同组织,花时,相对表达,赣南,对照品,荷尔,暗示,花器,成花转变
AB值:
0.202192
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