典型文献
大白菜KCS基因家族鉴定及在蜡粉近等基因系中表达分析
文献摘要：
β-酮脂酰辅酶A合成酶(β-ketoacyl-CoA synthase,KCS)是超长链脂肪酸合成中的限速酶,通过对大白菜KCS基因家族鉴定分析,为揭示KCS在控制大白菜蜡质性状中的具体功能研究奠定了基础.利用生物信息学的分析方法鉴定大白菜KCS基因家族成员,分析其亲缘关系、蛋白质理化性质、染色体定位、共线性关系、基因结构、蛋白保守域结构和基因表达模式.从大白菜全基因组共鉴定到32个BrKCS基因成员分成4个亚组,不均匀地分布在10条染色体上.BrKCS氨基酸长度和分子量的范围分别为181-755 aa和20.54-84.83 kD.共线性分析表明BrKCS5、BrKCS8和BrKCS13等7个家族成员与拟南芥共线性的BrKCS基因发生两倍化,1个家族成员(BrKCS9)发生了三倍化.基因结构分析显示,不同成员编码的氨基酸序列外显子数目及位置存在差异.转录组分析表明,BrKCS5、BrKCS6b与BrKCS10b基因在大白菜不同器官/组织尤其在花器官中可能参与蜡粉的合成.qRT-PCR分析结果验证了转录组数据的可靠性.综上所述,从大白菜全基因组共鉴定到32个BrKCS,其中3个基因在蜡粉近等基因系中表达量高且差异显著,为解析BrKCS基因在控制大白菜蜡质性状中的分子机制奠定了基础.
文献关键词：
大白菜;KCS基因家族;蜡质;多倍化;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
王荣花;王树彬;张志刚;赵智中;李巧云;王立华;刘栓桃
作者机构：
山东省农业科学院蔬菜研究所 国家蔬菜改良中心山东分中心 山东省设施蔬菜生物学重点实验室 农业部黄淮地区蔬菜科学观测实验站 (山东),济南 250100
文献出处：
引用格式：
[1]王荣花;王树彬;张志刚;赵智中;李巧云;王立华;刘栓桃-.大白菜KCS基因家族鉴定及在蜡粉近等基因系中表达分析)[J].生物技术通报,2022(04):86-96
A类：
BrKCS,BrKCS5,BrKCS8,BrKCS13,BrKCS9,BrKCS6b,BrKCS10b
B类：
大白菜,基因家族鉴定,蜡粉,近等基因系,表达分析,辅酶,合成酶,ketoacyl,CoA,synthase,超长链脂肪酸,脂肪酸合成,限速酶,鉴定分析,蜡质,功能研究,利用生物,亲缘关系,染色体定位,基因结构,基因表达模式,全基因组,分子量,aa,kD,共线性分析,拟南芥,两倍,三倍,氨基酸序列,外显子,转录组分析,不同器官,花器官,qRT,转录组数据,综上所述,多倍化
AB值：
0.246474
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