典型文献
小麦OSCA基因家族全基因组鉴定及表达分析
文献摘要：
[目的]在全基因组水平对小麦(Triticum aestivum L.)OSCA家族成员(TaOSCAs)进行鉴定,以明确TaOSCA在小麦中的潜在生物学功能.[方法]利用BLASTP结合保守结构域筛选的方法鉴定小麦TaOSCA蛋白.用生物信息学方法分析TaOSCA基因家族成员系统发育关系,基因结构及跨膜结构域;利用公开的转录组数据分析TaOSCA在小麦不同发育阶段不同器官/组织的表达谱;以小麦品种中国春为材料,进行PEG-6000模拟的渗透胁迫处理,用实时荧光定量PCR检测叶片TaOSCAs在渗透胁迫下表达模式.[结果]从小麦中鉴定到35个TaOSCA 蛋白;TaOSCAs 分为 TaOSCA Ⅰ、TaOSCAⅡ、TaOSCAⅢ 和 TaOSCAⅣ 4 个亚家族,分别有 15,16,3 和 1 个成员.基因结构分析结果表明,除TaOSCA4.1-4B外,其余TaOSCA均包含多个外显子.跨膜结构域分析结果表明,除TaOSCA2.3-4B有5个跨膜结构域(TMs)外,其余TaOSCA成员均包含8～11个TMs.TaOSCAs在小麦不同发育时期各器官中的表达结果表明,TaOSCA1.1-3B/3D、TaOSCA1.2-1A/1B/1D、TaOSCA1.3-1A、TaOSCA1.6-1A/1D和TaOSCA3.1-2B/2D在全生育期高水平表达,TaOSCA1.4-2A/2B/2D在不同发育阶段的根组织中均高表达,TaOSCA1.5-1B/1D在生殖生长期穗中高表达,TaOSCA1.6-1B、TaOSCA2.6-3B/3D在生殖生长期籽粒中高表达,表明这些基因可能在根、穗及籽粒发育过程中发挥重要功能.渗透胁迫处理下,TaOSCA2.4和TaOSCA4.1表达下调,TaOSCA2.5的表达无显著变化,TaOSCA1.1、TaOSCA1.2等11个TaOSCA基因表达上调,说明这11个基因可能在小麦苗期响应渗透胁迫中发挥作用.[结论]TaOSCA基因可能在小麦响应渗透胁迫的过程中发挥重要作用.
文献关键词：
小麦;干旱胁迫;TaOSCA;系统发育;特异性表达
中图分类号：
作者姓名：
张红娟;朱德鹤;杜琳颖;毛虎德
作者机构：
杨凌职业技术学院生物工程分院,陕西杨凌712100;西北农林科技大学植物保护学院 陕西杨凌712100;西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨凌712100
文献出处：
引用格式：
[1]张红娟;朱德鹤;杜琳颖;毛虎德-.小麦OSCA基因家族全基因组鉴定及表达分析)[J].西北农林科技大学学报（自然科学版）,2022(12):25-33,42
A类：
TaOSCAs,TaOSCA,TaOSCA4,TaOSCA2,TaOSCA1,TaOSCA3
B类：
基因家族,全基因组鉴定,表达分析,Triticum,aestivum,生物学功能,BLASTP,保守结构域,生物信息学方法,成员系统,系统发育关系,基因结构,跨膜结构域,转录组数据,发育阶段,不同器官,表达谱,小麦品种,PEG,渗透胁迫,胁迫处理,表达模式,亚家族,4B,外显子,TMs,不同发育时期,各器官,3B,1A,1B,1D,2B,2D,全生育期,2A,根组织,生殖生长期,籽粒发育,重要功能,小麦苗期,干旱胁迫,特异性表达
AB值：
0.21711
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