典型文献
布鲁氏菌外膜蛋白OmpW家族蛋白生物信息预测
文献摘要:
目的 利用生物信息学分析方法预测布鲁氏菌外膜蛋白OmpW家族蛋白(OmpW family protein)的理化性质、信号肽、蛋白结构和抗原表位,为布鲁氏病基因疫苗的研制提供理论基础.方法 从GenBank中获取OmpW家族蛋白的氨基酸序列,运用在线软件Port-Param分析OmpW家族蛋白的理化性质;采用UCL在线分析工具预测OmpW家族蛋白的二级结构,SWISS-MODEL在线分析工具预测其三级结构.结果 利用在线软件预测布鲁氏菌外膜蛋白OmpW分子式为C1136H1717N281O321,脂肪族指数为91.63,理论蛋白等电点(pI值)为5.67,原子总数为3457,其氨基酸序列Ala(A)占12.3%、Gly(G)占10.6%.正电荷残基(Arg+Lys)、负电荷残基(Asp+Glu)总数分别为16和18,其不稳定系数为23.01.该蛋白为稳定蛋白,亲水性系数为GRAVY为0.143.结论 OmpW有一个跨膜结构域,存在糖基化位点和磷酸化位点,具有多个抗原表位.二级结构有链、螺旋和卷曲;三级结构为单聚体,属于外膜蛋白家族.本研究结果为进一步研究布鲁氏菌外膜蛋白OmpW家族蛋白及疫苗的开发与研制提供了理论依据.
文献关键词:
布鲁氏菌;OmpW家族蛋白;生物信息预测
中图分类号:
作者姓名:
薄雅宁;庄添瑞;高玥;孙靖楠;胡海;王锐;高志祥;于慧
作者机构:
包头医学院乌兰察布临床医学院;包头医学院公共卫生学院;包头医学院中医学院;包头医学院口腔医学院;包头医学院基础医学与法医学院,内蒙古包头 014040;内蒙古自治区人民医院检验科,内蒙古呼和浩特010010
文献出处:
引用格式:
[1]薄雅宁;庄添瑞;高玥;孙靖楠;胡海;王锐;高志祥;于慧-.布鲁氏菌外膜蛋白OmpW家族蛋白生物信息预测)[J].现代医学与健康研究(电子版),2022(23):13-17
A类:
OmpW,C1136H1717N281O321
B类:
布鲁氏菌外膜蛋白,生物信息预测,利用生物,生物信息学分析,family,protein,信号肽,蛋白结构,抗原表位,基因疫苗,GenBank,氨基酸序列,Port,Param,UCL,在线分析工具,二级结构,SWISS,MODEL,其三,三级结构,软件预测,分子式,脂肪族,等电点,pI,Ala,Gly,正电荷,残基,Arg+Lys,负电荷,Asp+Glu,不稳定系数,亲水性,GRAVY,跨膜结构域,糖基化位点,磷酸化,卷曲,白家,白及
AB值:
0.325057
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