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SARS-CoV-2刺突糖蛋白结构特征和抗原表位分析
文献摘要：
目的:为深入了解新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)的刺突糖蛋白(spike glycoprotein)的结构特征和抗原表位.方法:以SARS-CoV-2的刺突糖蛋白的氨基酸序列为对象,通过Clustalw2.1比对分析与SARS-CoV的相似性;并且利用ProtParam分析刺突糖蛋白的理化性质;ProtScale分析亲/疏水性;TMHMM 2.0、SignalP 4.0、Netphos 3.1、NetGlyc 1.0对刺突糖蛋白的跨膜区域、信号肽、磷酸化和糖基化位点进行预测和分析;SOMPA和SWISS-MODEL服务器预测刺突糖蛋白的二级结构、三级结构模型;Prankweb平台分析可能的配体结合区域位点;ABCpred和SYFPEITHI对刺突糖蛋白进行B/T细胞表位的预测分析.结果:SARS-CoV-2刺突糖蛋白由1273个氨基酸构成,其中亮氨基酸含量最高;分子量为141178.47 kDa,等电点为6.24,半衰期为30 h,稳定系数为33.01;含有一个跨膜结构域和信号肽;存在136个磷酸化与17个N-糖基化修饰位点;二级结构主要以不规则卷曲结构构成,三级结构能与已知的7cn8.1.A(SMTL ID)模型同源建模;具有多个配体结合位点区域以及24个B细胞表位和12个T细胞表位.结论:通过生物信息学方法分析SARS-CoV-2刺突糖蛋白性质和表位,为促进新冠病毒肺炎疫苗和药物的研发提供参考.
文献关键词：
新型冠状病毒(SARS-CoV-2);刺突糖蛋白;抗原表位;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
王道;陈建林
作者机构：
中南大学湘雅二医院妇产科,长沙 410011
文献出处：
引用格式：
[1]王道;陈建林-.SARS-CoV-2刺突糖蛋白结构特征和抗原表位分析)[J].湖南师范大学学报（医学版）,2022(06):29-37
A类：
Clustalw2,Netphos,NetGlyc,SOMPA,Prankweb,配体结合区域,7cn8,SMTL
B类：
SARS,CoV,刺突糖蛋白,蛋白结构,抗原表位,severe,acute,respiratory,syndrome,coronavirus,spike,glycoprotein,氨基酸序列,比对分析,ProtParam,ProtScale,疏水性,TMHMM,SignalP,信号肽,磷酸化,糖基化位点,SWISS,MODEL,服务器,二级结构,三级结构,ABCpred,SYFPEITHI,细胞表位,预测分析,氨基酸含量,分子量,kDa,等电点,半衰期,稳定系数,跨膜结构域,糖基化修饰,修饰位点,卷曲结构,ID,同源建模,结合位点,生物信息学方法,蛋白性质,新冠病毒肺炎,肺炎疫苗
AB值：
0.323066
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