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典型文献
大豆胞囊线虫相关G2-like转录因子生物信息学分析
文献摘要:
G2-like转录因子在植物中广泛存在,是GARP转录因子超家族中重要成员之一,在叶绿体发育、果实生长、生物或非生物胁迫和植物衰老等方面均起重要作用.研究对大豆胞囊线虫3号生理小种胁迫下东农L-10(抗病)根部进行转录组测序,初步筛选得到8个与大豆胞囊线虫抗性相关G2-like转录因子,并通过在线软件对其作生物信息学分析.结果表明,G2-like家族成员中8个G2-like转录因子均定位于细胞核,为亲水性蛋白;蛋白质二级结构大多以无规则卷曲为主;GlGLK-3含有与大豆生长发育及逆境胁迫密切相关顺式作用元件.GlGLK-1、GlGLK-2、GlGLK-5和GlGLK-7与拟南芥ATGLK1和ATGLK2亲缘关系最近,预示其在功能上相似性.
文献关键词:
大豆;G2-like;转录因子;生物信息学分析
作者姓名:
韩英鹏;李一;吴桐;徐爱佟;白芮瑶;卜凡珊;姜海鹏
作者机构:
东北农业大学大豆研究所,哈尔滨 150030
引用格式:
[1]韩英鹏;李一;吴桐;徐爱佟;白芮瑶;卜凡珊;姜海鹏-.大豆胞囊线虫相关G2-like转录因子生物信息学分析)[J].东北农业大学学报,2022(03):1-9
A类:
GlGLK,ATGLK1,ATGLK2
B类:
大豆胞囊线虫,G2,like,生物信息学分析,GARP,超家族,叶绿体发育,果实生长,或非,非生物胁迫,植物衰老,生理小种,根部,转录组测序,初步筛选,选得,细胞核,亲水性,蛋白质二级结构,无规则,卷曲,逆境胁迫,顺式作用元件,拟南芥,亲缘关系,预示
AB值:
0.243784
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