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曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析
文献摘要：
[目的]筛选红豆杉NAC转录因子家族中影响根系形成的关键基因,探索红豆杉根系生长发育分子机理.[方法]利用曼地亚红豆杉全长转录组数据,通过生物信息学方法鉴定NAC转录因子,并对筛选出的NAC转录因子进行蛋白结构及基因组织表达谱等分析.[结果]共鉴定出44个NAC转录因子,其在N端均具有典型的保守NAC结构域,分别聚类到拟南芥的7个亚家族中,蛋白三级结构较为相似,且成员大多含有5个保守亚结构域.组织表达谱显示TmNAC15、16、18、21、22、29、39、40、41和44在根中表达水平高于茎和叶.[结论]从曼地亚红豆杉中共鉴定出44个NAC转录因子,其结构较为保守,且聚类为7个亚家族,其中成员TmNAC21、22、39、40和44极有可能参与红豆杉根系生长发育.
文献关键词：
红豆杉;NAC基因;基因鉴定;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
张恺恺;杨立莹;丰美静;张林凤;陈段芬;邱德有;杨艳芳
作者机构：
中国林业科学研究院林业研究所,林木遗传育种国家重点实验室,国家林业和草原局林木培育重点实验室,北京 100091;中国花卉协会,北京 100020;河北农业大学园艺学院,河北保定 071001
文献出处：
引用格式：
[1]张恺恺;杨立莹;丰美静;张林凤;陈段芬;邱德有;杨艳芳-.曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析)[J].林业科学研究,2022(02):97-103
A类：
TmNAC15,TmNAC21
B类：
曼地亚红豆杉,基因家族鉴定,表达分析,中影,根系形成,关键基因,根系生长,育分,分子机理,全长转录组,转录组数据,生物信息学方法,蛋白结构,组织表达谱,结构域,拟南芥,亚家族,三级结构,亚结构,基因鉴定
AB值：
0.228939
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