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毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析
文献摘要：
AUX1/LAX家族是一类生长素输入载体,在植物生长发育和形态建成过程中起着重要的调控作用.利用同源比对的方法从毛竹基因组中鉴定出8个PheAUX1/LAX候选基因,进行系统进化树、基因结构、基序分析.结果 表明,PheAUX1/LAX候选基因分为Class Ⅰ和Class Ⅱ2个亚组,其中class工的候选基因包含6～7个外显子,而ClassⅡ的候选基因包含8～10个外显子.不同组织器官转录组数据分析表明多数Class Ⅰ候选成员在毛竹冬笋中高丰度表达,而ClassⅡ中的PH02Gene38722.t在跳鞭中高丰度表达.通过qRT-PCR对AUX1/LAX候选基因在不同生长发育时期笋中的表达量分析表明,有6个候选基因与对照相比呈现出不同程度的上调表达,表明PheAUX1/LAX候选基因广泛参与毛竹笋的生长发育.本研究将为进一步研究毛竹AUX1/LAX基因的功能和调控机制奠定理论基础.
文献关键词：
AUX1/LAX;毛竹;基因表达;生物信息学
中图分类号：
作者姓名：
杨乐;张康;李龙
作者机构：
西北农林科技大学林学院,陕西杨陵712100
文献出处：
引用格式：
[1]杨乐;张康;李龙-.毛竹AUX1/LAX候选基因家族鉴定与表达分析)[J].西北林学院学报,2022(01):89-95
A类：
PheAUX1,PH02Gene38722
B类：
LAX,候选基因,基因家族鉴定,表达分析,生长素,植物生长发育,形态建成,同源比对,系统进化树,基因结构,基序,Class,class,外显子,不同组织,组织器官,转录组数据,选成,冬笋,高丰度,qRT,生长发育时期,表达量分析,毛竹笋,调控机制
AB值：
0.242462
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