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典型文献
毛白杨PtYABBY基因家族3个成员的克隆与表达分析
文献摘要:
[目的]YABBY是高等植物中特有的转录因子家族,在侧生器官发育和开花过程中发挥重要作用.本研究对毛白杨PtYABBY基因进行克隆和生物信息学分析,并对雌雄花芽8个关键发育时期和根茎叶等组织中PtYABBY基因表达模式进行探究,以期为阐明PtYABBY基因在毛白杨侧生器官发育过程中的功能奠定前期基础.[方法]以毛白杨为试材,采用同源基因克隆法从毛白杨中分离FILAMENTOUS FLOWER (FIL)/YABBY3 (YAB3)同源基因PtYABBY3、PtYABBY4和PtYABBY11的编码区序列,并开展生物信息学分析.通过qRT-PCR研究这3个基因在雌雄花芽8个发育时期及根、茎、幼叶、成熟叶片中的表达规律.[结果]PtYABBY3、PtYABBY4和PtYABBY11编码区长度分别为633、642、639 bp,分别编码210、213、212个氨基酸.所推测的氨基酸序列包含C2C2锌指结构域和YABBY结构域.系统进化分析进一步表明这3个基因属于FIL/YAB3亚家族成员.qRT-PCR结果显示这3个基因在根、茎、叶及8个时期雌雄花芽组织中均有表达,但PtYABBY基因间的表达水平存在明显差异.PtYABBY3表达水平在雌雄花芽发育初期下调,发育后期上调;花原基形成到休眠期内PtYABBY3在雌雄花芽中呈现相反的表达变化趋势.PtYABBY4和PtYABBY11基因在雌雄株成花诱导期表达水平最高,成花诱导到伸长期内呈现下降趋势,在雄花芽休眠期和小孢子发生期基因表达水平无明显变化.营养组织表达量测定结果显示这3个基因在幼叶和成熟叶片中表达水平相对较高,根系中表达量最低.[结论]YABBY基因家族成员PtYABBY3、PtYABBY4和PtYABBY11同属FIL/YAB3亚类,在毛白杨雌雄花芽发育的8个时期中表达水平存在较大差异,且在叶片和花芽中表达量较高,表明其可能与叶片和花芽发育相关.本研究为今后深入研究YABBY家族成员在杨树器官生长发育过程中的作用奠定基础.
文献关键词:
毛白杨;YABBY;克隆;表达模式;雌雄花芽
作者姓名:
郝颖颖;周明珠;韩开元;杨雄;高钰涵;陈仲
作者机构:
北京林业大学林学院,省部共建森林培育与保护教育部重点实验室,国家能源非粮生物质原料研究中心,北京 100083
引用格式:
[1]郝颖颖;周明珠;韩开元;杨雄;高钰涵;陈仲-.毛白杨PtYABBY基因家族3个成员的克隆与表达分析)[J].北京林业大学学报,2022(01):48-57
A类:
PtYABBY,FILAMENTOUS,FLOWER,YABBY3,PtYABBY3,PtYABBY4,PtYABBY11
B类:
毛白杨,基因家族,克隆与表达,表达分析,高等植物,器官发育,开花,生物信息学分析,雌雄花芽,发育时期,根茎叶,基因表达模式,同源基因,基因克隆,YAB3,编码区,qRT,幼叶,成熟叶片,表达规律,区长,bp,分别编,氨基酸序列,C2C2,锌指,结构域,系统进化分析,亚家族,花芽发育,原基形成,休眠期,表达变化,雌雄株,成花诱导,诱导期,伸长期,芽休眠,小孢子发生,发生期,基因表达水平,组织表达,测定结果,根系,同属,亚类,杨树,官生
AB值:
0.216712
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