典型文献
毛果杨nsLTP基因家族全基因组水平鉴定及其表达特性分析
文献摘要：
植物非特异性脂质转移蛋白(non-specific lipid transfer proteins,nsLTP)是一类多基因家族编码碱性蛋白,负责脂肪酸体外结和与膜之间的磷脂转移,在植物生长发育和逆境胁迫响应中扮演着重要角色.目前为止,尚无模式植物毛果杨(Populus trichocarpa)nsLTP家族的研究报导.本研究从全基因组水平对PtrnsLTP家族成员的基因数量、亲缘关系、基因结构、编码蛋白保守基序等特性进行了分析,结果表明:PtrnsLTP家族共由39个基因组成,进化成5个亚家族,其中A亚族含有6个基因、B亚族含有2个、C亚族含有13个、D亚族含有3个、E亚族含有15个.PtrnsLTP家族包含7对旁系同源基因,其中1对大于1,6对Ka/Ks均远小于1,且这6对基因均处于同一个大的进化分支上,进化压力的不同导致基因间的功能出现了分化,编码蛋白均含有Motif 1和Motif 2保守基序.利用qRT-PCR技术并结合杨树转录组数据对PtrnsLTP的组织表达与盐胁迫响应特性研究发现:各家族成员在毛果杨根、茎和叶中均有表达且经qRT-PCR技术验证后与网站预测结果基本吻合,有11、15和13个成员分别在根、茎和叶中有较高的表达,表明该基因家族参与了杨树不同组织的生长发育;NaCl胁迫下,该家族39个基因中分别有26个成员在根部、14个成员在叶部表达量随着胁迫时间的增加而升高,而32个基因在茎部表现为先升高后降低的趋势.本研究结果对于PtrnsLTP家族基因生物学功能的鉴定与盐胁迫响应基因资源的工作有着积极的推动作用.
文献关键词：
毛果杨;nsLTP;生物信息学分析;盐胁迫
中图分类号：
作者姓名：
程赫;田双慧;张洋;刘聪;夏德安;魏志刚
作者机构：
林木遗传育种国家重点实验室,东北林业大学,哈尔滨 150040;国家林业和草原局盐碱地研究中心,中国林业科学研究院,北京 100091
文献出处：
引用格式：
[1]程赫;田双慧;张洋;刘聪;夏德安;魏志刚-.毛果杨nsLTP基因家族全基因组水平鉴定及其表达特性分析)[J].植物研究,2022(03):412-423
A类：
nsLTP,PtrnsLTP
B类：
毛果杨,基因家族,全基因组,表达特性,非特异性,specific,lipid,transfer,proteins,多基因,磷脂,植物生长发育,逆境胁迫响应,目前为止,Populus,trichocarpa,报导,亲缘关系,基因结构,编码蛋白,保守基序,亚家族,旁系,同源基因,Ka,Ks,同一个,进化分支,Motif,qRT,杨树,转录组数据,组织表达,盐胁迫,响应特性,各家,技术验证,家族参与,不同组织,NaCl,根部,茎部,家族基因,生物学功能,响应基因,基因资源,生物信息学分析
AB值：
0.327898
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
