典型文献
番红花R2R3-MYB转录因子的鉴定与时空表达分析
文献摘要:
R2R3-MYB转录因子是植物最大的转录因子家族之一,广泛参与了植物的次生代谢调控过程.为探究番红花(Crocus sativus)中R2R3-MYB转录因子的时空表达特征并筛选与番红花次生代谢相关的CsR2R3-MYB转录因子,本研究以其全长转录组测序数据为基础,利用生物信息学方法对CsR2R3-MYB转录因子进行鉴定和系统分析,并用qRT-PCR对其时空表达模式进行探讨.从番红花转录组中筛选出42个R2R3-MYB转录因子,理化性质分析结果显示均为不稳定亲水性蛋白,亚细胞定位预测结果显示大部分在细胞核中表达.与拟南芥(Arabidopsis thaliana)R2R3-MYB一同构建进化树,可将CsR2R3-MYB分为26个亚类,根据同源蛋白功能保守特性推测与S7、S19、S20亚组同源的CsMYB9、CsMYB16、CsMYB17、CsMYB18、CsMYB20和CsMYB21通过响应茉莉酸(jasmonic acid,JA)信号参与番红花活性物质的次生代谢调控.基因表达模式结果表明:CsMYB5、CsMYB6、CsMYB7、CsMYB9、CsMYB10、CsMYB13、CsMYB17、CsMYB19、CsMYB21、CsMYB22、CsMYB23、CsMYB26、CsMYB28、CsMYB30、CsMYB31与CsMYB32在柱头中表现出较高的表达量,并且响应了JA信号.前期研究发现JA可促进番红花类黄酮的生物合成,结合系统进化树及表达分析结果,筛选出CsMYB9、CsMYB17和CsMYB21可能通过响应JA信号参与番红花次生代谢进行调控.本研究为后续探究CsR2R3-MYB的功能提供参考,也为番红花次生代谢转录调控研究提供思路.
文献关键词:
番红花;R2R3-MYB转录因子;生物信息学分析;表达模式;次生代谢
中图分类号:
作者姓名:
吴瑞;林定;罗栋;周伊汝;张凌翼;邵清松;邢丙聪
作者机构:
浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室,杭州311300;浙江农林大学食品与健康学院,杭州311300
文献出处:
引用格式:
[1]吴瑞;林定;罗栋;周伊汝;张凌翼;邵清松;邢丙聪-.番红花R2R3-MYB转录因子的鉴定与时空表达分析)[J].农业生物技术学报,2022(03):457-472
A类:
CsR2R3,CsMYB9,CsMYB16,CsMYB17,CsMYB18,CsMYB20,CsMYB21,CsMYB5,CsMYB6,CsMYB7,CsMYB10,CsMYB13,CsMYB19,CsMYB22,CsMYB23,CsMYB26,CsMYB28,CsMYB30,CsMYB31,CsMYB32
B类:
番红花,表达分析,次生代谢,代谢调控,Crocus,sativus,表达特征,全长转录组测序,序数,利用生物,生物信息学方法,qRT,时空表达模式,性质分析,定亲,亲水性,亚细胞定位,定位预测,细胞核,拟南芥,Arabidopsis,thaliana,一同,亚类,同源蛋白,蛋白功能,S7,S19,S20,过响应,茉莉酸,jasmonic,acid,JA,活性物质,基因表达模式,柱头,头中,前期研究,类黄酮,生物合成,系统进化树,转录调控,调控研究,生物信息学分析
AB值:
0.204082
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