典型文献
瓦氏雅罗鱼Commd9基因的克隆及其在碱度胁迫下的表达分析
文献摘要：
铜转运Murr1结构域(copper metabolism Murr1 domain,COMMD)蛋白家族在生物体中广泛存在,参与机体核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)活性调节、钠转运、铜代谢以及缺氧的适应性调节等生物学过程.为研究Commd9在碱度胁迫下的作用,本研究采用cDNA末端快速扩增(rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次对具有耐高碱特性的瓦氏雅罗鱼(Leuciscus waleckii)Commd9基因cDNA全长进行了克隆,命名为LwCommd9基因(GenBank No.MT013199).该序列全长为938 bp,5'和3'非编码区分别为5和339 bp,开放阅读框为594 bp,编码蛋白含197个氨基酸,预测分子量为21.79 kD,理论等电点为5.63.系统发育分析显示,瓦氏雅罗鱼COMMD9氨基酸序列与鲤科鱼类的相似性较高,其中与鱇浪白鱼(Anabarilius grahami)相似性高达93.37％.qPCR发现,LwCommd9基因在各组织中均有分布,在肝和肾组织中表达量显著高于其他组织(P<0.05).高碳酸盐碱度胁迫下,LwCommd9基因在碱水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著下调(P<0.01),而在淡水种群瓦氏雅罗鱼肝组织中的表达量极显著上调(P<0.01),在肾组织中也有相同变化趋势.综上所述,LwCommd9基因在瓦氏雅罗鱼高碱适应过程中可能起到了关键作用,这将为后续鱼类耐高碱机制研究提供参考.
文献关键词：
瓦氏雅罗鱼;铜转运Murr1结构域9 (Commd9)基因;基因表达;碱度胁迫
中图分类号：
作者姓名：
罗亮;常玉梅;孙博;张立民;陈炯;梁利群
作者机构：
宁波大学海洋学院/生物化学与分子生物学实验室宁波315832;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所/黑龙江省特殊生境鱼类种质特性与抗逆育种重点实验室哈尔滨150070
文献出处：
引用格式：
[1]罗亮;常玉梅;孙博;张立民;陈炯;梁利群-.瓦氏雅罗鱼Commd9基因的克隆及其在碱度胁迫下的表达分析)[J].农业生物技术学报,2022(09):1771-1782
A类：
Commd9,碱度胁迫,Murr1,COMMD,LwCommd9,MT013199,COMMD9,鱇浪白鱼,碳酸盐碱度胁迫
B类：
瓦氏雅罗鱼,表达分析,铜转运,结构域,copper,metabolism,domain,白家,生物体,核因子,nuclear,铜代谢,适应性调节,生物学过程,cDNA,rapid,amplification,ends,RACE,高碱,Leuciscus,waleckii,全长,长进,GenBank,No,bp,非编码区,开放阅读框,编码蛋白,分子量,kD,等电点,系统发育分析,氨基酸序列,鲤科,鱼类,Anabarilius,grahami,qPCR,肾组织,组织中表达,他组织,高碳酸盐,碱水,鱼肝,肝组织,淡水,综上所述,适应过程
AB值：
0.310012
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