典型文献
洋葱黄矮病毒的实时荧光RT-PCR检测方法
文献摘要:
洋葱黄矮病毒(Onion yellow dwarf virus,OYDV)是危害葱属植物的主要病毒之一.本试验根据OYDV外壳蛋白(coat protein,CP)基因保守序列设计特异性引物,建立并优化了OYDV实时荧光RT-PCR检测方法,并对其特异性、敏感性和重复性进行了验证.结果显示:标准曲线Ct值与模板拷贝数的对数呈良好的线性关系,相关系数R2为0.996,扩增效率为95.921%;与青葱X病毒(Shallot virus X,SVX)、葱潜隐病毒(Shallot latent virus,SLV)均无交叉反应;最低检出限为2.0×102 copies· μL-1,比常规RT-PCR大约高1000倍;组内和组间变异系数均小于2%,具有良好的重复性.利用该方法对分别采集的各45份疑似OYDV感染的分蘖洋葱(珠葱)和大蒜样品进行检测,检出率较常规RT-PCR分别高40.00、6.67百分点,能更加客观地反映样品带毒情况.本试验建立的OYDV实时荧光RT-PCR方法具有良好的特异性、敏感性和重复性,可用于田间样品OYDV检测,为OYDV的有效防控提供技术支持.
文献关键词:
分蘖洋葱(珠葱);大蒜;洋葱黄矮病毒;实时荧光RT-PCR
中图分类号:
作者姓名:
刘建青;王韬远;李小宇;张春雨;苏颖;魏健;张金花;王永志
作者机构:
吉林省农业科学院,吉林公主岭 136100;长春师范大学生命科学学院,吉林长春 130032;芜湖职业技术学院,安徽芜湖 241000
文献出处:
引用格式:
[1]刘建青;王韬远;李小宇;张春雨;苏颖;魏健;张金花;王永志-.洋葱黄矮病毒的实时荧光RT-PCR检测方法)[J].中国蔬菜,2022(03):72-77
A类:
洋葱黄矮病毒,OYDV,Shallot,SVX
B类:
Onion,yellow,dwarf,virus,葱属,外壳蛋白,coat,protein,CP,保守序列,序列设计,特异性引物,标准曲线,Ct,拷贝数,青葱,潜隐,latent,SLV,交叉反应,低检出限,copies,组间变异,分蘖洋葱,大蒜,百分点,带毒,毒情,于田,田间
AB值:
0.313626
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