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1型糖尿病患者NLRC4基因外显子罕见变异的鉴定及其对基因功能的影响
文献摘要:
目的:对1型糖尿病(T1DM)患者含NLR家族CARD域蛋白4(NLRC4)基因外显子及外显子内含子交界区的罕见变异进行鉴定,并探讨其对基因功能的影响。方法:选取2017年8月到2020年9月中南大学湘雅二医院代谢内分泌科508例T1DM患者作为病例组,男264例,女244例,年龄[
M(
Q1,
Q3)]为27(11,43)岁。同时选取同期体检科527名健康对照者,男290名,女237名,年龄[
M(
Q1,
Q3)]为47(36,60)岁。对T1DM患者和健康对照者的NLRC4基因的外显子区域进行捕获测序,并进行一代测序验证。构建NLRC4基因野生型和突变型质粒,转染293T细胞,采用免疫印迹试验(WB)检测NLRC4蛋白表达量以及含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶前体(procaspase-1)切割产物含量。在转染野生型或突变型NLRC4质粒的293T细胞中加入放线菌酮(CHX),检测NLRC4蛋白降解情况。使用免疫荧光检测NLRC4蛋白质的定位。酶联免疫吸附试验(ELISA)检测细胞上清白细胞介素(IL)-1β浓度。
结果:测序结果显示,4例患者及2名健康对照者NLRC4基因的3号外显子存在杂合变异c.208C>T;2例患者4号外显子存在杂合变异c.1564T>C,1例患者4号外显子存在c.1219G>C;这3种变异可能为T1DM的致病性变异。NLRC4野生型和c.208>T、c.1564T>C、c.1219G>C突变型质粒转染的293T细胞中,NLRC4蛋白表达水平、降解速率、定位以及procaspase-1的切割产物含量无明显改变;但转染c.1219G>C、c.208C>T突变型质粒的293T细胞分泌的IL-1β浓度[
M(
Q1,
Q3)]分别为15.25(12.98,17.52)、15.44(13.81,17.07)ng/L,均低于野生型质粒的18.70(16.59,20.81)ng/L(
P=0.020、0.010)。
结论:NLRC4基因外显子罕见变异c.208C>T、c.1564T>C和c.1219G>C可能不改变蛋白质的表达水平、蛋白质的降解及定位,但c.208C>T和c.1219G>C错义突变可能抑制了炎症因子IL-1β的产生,从而对基因功能产生影响。
文献关键词:
糖尿病,1型;炎症小体;外显子测序;功能学分析
中图分类号:
作者姓名:
许林凌;罗海荣;时夏捷;庞海鹏;李嘉琪;王祎梦;罗说明;林健;俞海波;肖扬;李霞;黄干;谢志国;周智广
作者机构:
国家代谢性疾病临床医学研究中心 糖尿病免疫学教育部重点实验室 中南大学湘雅二医院代谢内分泌科,长沙 410011
文献出处:
引用格式:
[1]许林凌;罗海荣;时夏捷;庞海鹏;李嘉琪;王祎梦;罗说明;林健;俞海波;肖扬;李霞;黄干;谢志国;周智广-.1型糖尿病患者NLRC4基因外显子罕见变异的鉴定及其对基因功能的影响)[J].中华医学杂志,2022(16):1216-1223
A类:
procaspase,208C,1564T,1219G
B类:
糖尿病患者,NLRC4,罕见变异,基因功能,T1DM,CARD,内含子,中南大学,大学湘,湘雅,代谢内分泌,内分泌科,Q1,Q3,体检科,子区域,一代测序,野生型,突变型,293T,免疫印迹试验,WB,含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶,放线菌酮,CHX,蛋白降解,降解情况,免疫荧光检测,酶联免疫吸附试验,上清,清白,杂合变异,致病性变异,质粒转染,蛋白表达水平,降解速率,变蛋,错义突变,炎症小体,外显子测序,功能学分析
AB值:
0.220569
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