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基于生物信息学分析CSRP1基因在胃癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系
文献摘要：
目的 基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库探讨CSRP1基因在胃癌中的表达及其与预后的相关性,并且分析CSRP1与免疫细胞浸润的关系.方法 采用生物信息学方法分析TCGA数据库中CSRP1在不同病理分期胃癌组织中的表达差异,使用Kaplan-Meier生存曲线分析其与胃癌患者预后的关系;将胃癌组织中与CSRP1共表达的基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并在STRING数据库中对其编码的蛋白质进行蛋白相互作用分析;并分析CSRP1与免疫细胞的相关性.结果 CSRP1高表达胃癌患者的总体生存期较低表达患者短;随着肿瘤浸润程度的增加,T2～T4期胃癌患者CSRP1的表达增加,差异有统计学意义(P<0.05).单因素和多因素Cox分析显示,CSRP1、年龄、肿瘤浸润程度、淋巴结转移可作为胃癌独立的预后指标;CSRP1表达水平与CD4+T细胞、辅助T细胞、树突状细胞以及自然杀伤细胞的免疫浸润水平呈负相关(P<0.05).结论 CSRP1高表达胃癌患者的预后较差,可能和CSRP1影响肿瘤微环境中的免疫细胞浸润有关,表明CSRP1可能成为胃癌潜在的免疫治疗靶点.
文献关键词：
CSRP1;胃癌;肿瘤基因组图谱;免疫浸润;生存分析
中图分类号：
作者姓名：
郭晨旭;李发展;刘斌;温慧娟;米阳;郑鹏远
作者机构：
郑州大学第五附属医院 马歇尔医学研究中心,河南 郑州 450052;郑州大学第五附属医院 消化内科,河南 郑州 450052;郑州大学 医学科学院,河南 郑州 450052
文献出处：
引用格式：
[1]郭晨旭;李发展;刘斌;温慧娟;米阳;郑鹏远-.基于生物信息学分析CSRP1基因在胃癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系)[J].河南医学研究,2022(14):2506-2511
A类：
B类：
生物信息学分析,CSRP1,免疫细胞浸润,肿瘤基因组图谱,TCGA,生物信息学方法,病理分期,胃癌组织,表达差异,Kaplan,Meier,生存曲线分析,胃癌患者,共表达,基因本体,富集分析,京都基因与基因组百科全书,STRING,蛋白相互作用,相互作用分析,总体生存期,低表达,肿瘤浸润程度,T4,Cox,淋巴结转移,预后指标,CD4+T,树突状细胞,自然杀伤细胞,免疫浸润水平,肿瘤微环境,免疫治疗,治疗靶点,生存分析
AB值：
0.226534
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