典型文献
SETDB2在甲状腺癌中的表达及临床意义
文献摘要:
目的 利用TCGA数据库探讨SETDB2与甲状腺癌(THCA)临床特征之间的相关性.方法 在TCGA数据库下载510例甲状腺癌患者和58份癌旁对照组织样本的临床数据和RNA-seq结果,探究SETDB2在甲状腺癌患者肿瘤组织和健康对照组织中的表达;应用HPA和GEO数据库检索SETDB2基因的表达;采用UALCAN数据库分析SETDB2表达水平和甲状腺癌患者临床病理特征之间的关系;通过GEPIA数据库评估甲状腺癌患者无进展间隔期(PFI)与SETDB2表达水平的关系;使用ROC曲线下面积(AUC)评估SETDB2作为甲状腺癌患者分类的价值;利用LinkedOmics数据库分析甲状腺癌中与SETDB2共表达的基因及其富集分析;利用TIMER2.0在线分析免疫细胞浸润,评估SETDB2的表达水平对免疫治疗的反应.结果 甲状腺癌组织中SETDB2表达水平低于正常对照组(P<0.05);甲状腺癌患者中SETDB2的低表达与T期、淋巴结转移、肿瘤残余和肿瘤分期有关(P<0.05);ROC曲线显示,SETDB2在甲状腺癌分类中具有较高的诊断价值(AUC=0.898);SETDB2表达降低与患者较差的PFI相关(P<0.05);SETDB2可能参与抗菌素的体液反应和细胞凋亡;SETDB2低表达与免疫细胞的浸润能力增强有关.结论 SETDB2表达降低与甲状腺癌患者预后较差和免疫细胞浸润增强相关,提示SETDB2可能可以作为甲状腺癌的预后生物标志物.
文献关键词:
甲状腺癌;SETDB2;肿瘤免疫浸润;免疫治疗
中图分类号:
作者姓名:
张伟;钱玥;金雪;王艺贤;牟丽丽
作者机构:
贵州护理职业技术学院基础医学部,贵州 贵阳 550000
文献出处:
引用格式:
[1]张伟;钱玥;金雪;王艺贤;牟丽丽-.SETDB2在甲状腺癌中的表达及临床意义)[J].医学信息,2022(24):12-17
A类:
SETDB2
B类:
TCGA,THCA,下载,甲状腺癌患者,癌旁,临床数据,seq,肿瘤组织,HPA,GEO,数据库检索,UALCAN,数据库分析,临床病理特征,GEPIA,间隔期,PFI,患者分类,LinkedOmics,共表达,富集分析,TIMER2,在线分析,免疫细胞浸润,免疫治疗,癌组织,低于正常,正常对照,低表达,淋巴结转移,肿瘤残余,肿瘤分期,诊断价值,抗菌素,体液,浸润能力,增强相,预后生物标志物,肿瘤免疫浸润
AB值:
0.241431
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