典型文献
结肠腺癌免疫预后基因的开发与验证
文献摘要：
目的 发掘结肠腺癌(colon adenocarcinoma,COAD)免疫预后标志物并精准预测COAD生存风险.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载COAD患者的临床信息以及RNA-seq数据,获取差异的免疫相关基因(differential immune related gene,DEIRG).利用单变量和多变量Cox比例风险回归模型鉴定具有预后价值的免疫基因构建模型.利用Kaplan-Meier法分析模型中高风险和低风险患者的生存状态,并使用受试者操作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线评估该风险评分模型的准确度,并且从样本中随机抽取70％的病例作内部验证.采用单因素和多因素Cox回归分析,确定COAD的独立预后因素.结果 利用单因素和多因素Cox比例风险回归分析确定载脂蛋白12(lipocalin 12,LCN12)、嗜铬素A(chromogranin A,CHGA)、抑制素β亚基(inhibin subunit beta B,INHBB)、R3H域包含像(R3H domain containing like,R3HDML)和黑皮质素1受体(melanocortin 1 receptor,MC1R)为COAD患者预后风险模型中的5个风险基因(均P<0.05),对该模型进行风险评分,高风险组患者总生存时间较低风险组短(P=0.007),在随机抽取的内部测试组中得到验证,高风险组患者预后较低风险组差(P=0.028).风险评分预测1年和3年总生存的ROC曲线下面积(area under curve,AUC)为0.715和0.683,内部验证组ROC AUC分别为0.736和0.673.单因素和多因素Cox分析显示,在实验组及内部验证组中风险评分是COAD的独立预后因素(P<0.01).结论 开发并验证的COAD免疫预后基因LCN12、CHGA、INHBB、R3HDML和MC1R可提高COAD筛查及诊断效率,并对鉴定高或低生存风险的COAD患者亚组的治疗具有意义.
文献关键词：
结肠腺癌;免疫预后基因;风险评分
中图分类号：
作者姓名：
向瑶;周伟弘;王桃丽;王俊普
作者机构：
中南大学湘雅医院病理科,湖南 长沙 410008;株洲市中心医院病理科,湖南 株洲 412007;中南大学基础医学院病理学系,湖南 长沙 410013
文献出处：
引用格式：
[1]向瑶;周伟弘;王桃丽;王俊普-.结肠腺癌免疫预后基因的开发与验证)[J].实用肿瘤杂志,2022(02):163-170
A类：
免疫预后基因,DEIRG,LCN12,R3H,R3HDML
B类：
结肠腺癌,开发与验证,colon,adenocarcinoma,COAD,预后标志物,精准预测,生存风险,癌症基因组图谱,Cancer,Genome,Atlas,TCGA,下载,临床信息,seq,免疫相关基因,differential,immune,related,gene,多变量,Cox,模型鉴定,预后价值,免疫基因,构建模型,Kaplan,Meier,生存状态,操作特征,receiver,operating,characteristic,风险评分模型,随机抽取,内部验证,独立预后因素,载脂蛋白,lipocalin,chromogranin,CHGA,亚基,inhibin,subunit,beta,INHBB,domain,containing,like,黑皮,皮质素,melanocortin,receptor,MC1R,预后风险模型,风险基因,高风险组,总生存时间,低风险组,内部测试,评分预测,area,under,curve,诊断效率
AB值：
0.376506
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