典型文献
基于TCGA数据库代谢相关基因构建乳腺癌预后模型
文献摘要：
目的 基于TCGA数据库构建乳腺癌代谢相关预后模型,揭示代谢与乳腺癌预后之间的关系.方法 代谢相关基因从KEGG数据库中获取,limma包用于去筛选TCGA数据库中1109例乳腺癌样本和113例正常对照的代谢相关差异基因,随机抽取70％样本作为训练集,剩余30％样本作为验证集,单因素Cox回归用于筛选预后相关基因,基于glmnet包构建代谢相关预后模型,并通过单因素和多因素Cox回归对模型进行验证.结果 本研究筛选出168个代谢相关差异基因,通过生存过滤及去掉过度拟合的基因后最终13个代谢相关的基因用作预后模型的构建,包括NMNAT2、NT5E、QPRT、UGP2、MTHFD2、TSTA3、TYMP、ALDH2、ALDH1A1、IDO1、IL4I1、INPP1和ENPP6.生存分析显示,高风险组患者生存时间显著长于低风险组(P<0.05).单因素和多因素Cox回归结果表明构建的代谢相关预后模型的风险得分是乳腺癌患者的一个独立预后因素.结论 本研究构建的预后模型揭示了代谢与乳腺癌预后之间的关系,为乳腺癌的诊断及研究提供了一个新的视角.
文献关键词：
乳腺癌;代谢相关基因;预测模型;基因特征;预后
中图分类号：
作者姓名：
李伟华;张广凤;马骊骊;何品;王雯;李顶夫
作者机构：
深圳大学第一附属医院,深圳市第二人民医院医学影像科 深圳 518035;深圳市第三人民医院放射科;深圳市眼科医院医学影像科;中国医学科学院肿瘤医院深圳医院;深圳大学第一附属医院,深圳市第二人民医院医学病理科
文献出处：
引用格式：
[1]李伟华;张广凤;马骊骊;何品;王雯;李顶夫-.基于TCGA数据库代谢相关基因构建乳腺癌预后模型)[J].实用肿瘤学杂志,2022(01):37-43
A类：
NMNAT2,UGP2,TSTA3,TYMP,INPP1,ENPP6
B类：
TCGA,代谢相关基因,预后模型,数据库构建,limma,正常对照,差异基因,随机抽取,训练集,验证集,Cox,预后相关基因,glmnet,去掉,过度拟合,NT5E,QPRT,MTHFD2,ALDH2,ALDH1A1,IDO1,IL4I1,生存分析,高风险组,生存时间,低风险组,乳腺癌患者,独立预后因素,研究构建,基因特征
AB值：
0.339141
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
