典型文献
基于癌症基因组图谱数据库探索miR-217在胃癌中的表达及其预后价值
文献摘要:
目的 评估miR-217在胃癌组织中的表达及其预后价值.方法 利用R语言统计学软件下载癌症基因组图谱数据库(TCGA)胃癌数据集中患者的临床病理学资料、生存数据和miRNA测序数据,比较miR-217在肿瘤组织与癌旁组织间的表达差异,受试者操作特征曲线(ROC)评估miR-217对胃癌的诊断价值;Kaplan-Meier生存分析比较不同miR-217表达水平的胃癌患者无进展时间(PFI)和总生存期(OS);利用单因素和多因素Cox回归分析评估影响PFI和OS的预后因子;利用基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)对miR-217潜在靶基因进行功能和信号通路富集分析.结果 446例胃癌患者纳入分析,Wilcoxon秩和检验结果显示,miR-217显著高表达于胃癌组织(5.10 vs.3.74,P<0.01).经ROC曲线评估发现,miR-217具有良好的诊断价值(AUC=0.795,95%CI:0.728~0.863).Kaplan-Meier结果显示,与低表达组比较,miR-217高表达的患者OS更短(56.2个月vs.22.3个月,P=0.005),但两组患者PFI之间的差异无统计学意义(55.9个月vs.26.0个月,P=0.099).多因素Cox回归分析结果显示,miR-217是影响患者OS的独立预后因子之一(HR=1.386,95%CI:1.003~1.914,P=0.048),但miR-217的表达与患者PFI无明显相关性(P>0.05).GO/KEGG富集分析结果表明,miR-217潜在的靶基因主要富集于前列腺癌、膀胱癌、黑色素瘤、子宫内膜癌、EGFR酪氨酸激酶抑制剂抵抗、细胞间蛋白转运调节、蛋白入核调节、神经分支形态、成长发育负向调节及核-浆转运调控等病理过程.结论 miR-217显著高表达于胃癌组织,其表达水平可用于预测胃癌患者的死亡风险;miR-217的生物学功能可能与泌尿生殖系统恶性肿瘤以及蛋白质转运等相关.
文献关键词:
胃癌;miR-217;预后因子;癌症基因组图谱数据库
中图分类号:
作者姓名:
郑侠;邵杰;谷雨;潘宇
作者机构:
210029 南京 江苏省中医院 南京中医药大学附属医院肿瘤科
文献出处:
引用格式:
[1]郑侠;邵杰;谷雨;潘宇-.基于癌症基因组图谱数据库探索miR-217在胃癌中的表达及其预后价值)[J].临床肿瘤学杂志,2022(09):788-793
A类:
B类:
癌症基因组图谱数据库,预后价值,胃癌组织,下载,TCGA,临床病理学,miRNA,序数,肿瘤组织,癌旁组织,表达差异,受试者操作特征曲线,诊断价值,Kaplan,Meier,生存分析,胃癌患者,无进展时间,PFI,总生存期,OS,Cox,分析评估,预后因子,基因本体论,京都基因与基因组百科全书,靶基因,信号通路富集,通路富集分析,Wilcoxon,秩和检验,低表达,前列腺癌,膀胱癌,黑色素瘤,子宫内膜癌,EGFR,酪氨酸激酶抑制剂,成长发育,病理过程,死亡风险,生物学功能,泌尿生殖系统,生殖系统恶性肿瘤,蛋白质转运
AB值:
0.25134
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。