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基于TCGA数据库构建头颈部鳞癌RNA甲基化调控因子预后模型
文献摘要：
目的 探讨RNA甲基化调控因子与头颈部鳞癌(HNSCC)患者预后的相关性.方法 从TCGA数据库获取HNSCC样本与正常样本的基因表达谱及临床数据,评估43个RNA甲基化调控因子预测预后的价值.使用LASSO回归分析构建预后模型,将患者按风险评分划为高、低风险组,并对模型进行评估.根据高、低风险组差异表达的基因进行GO富集分析和ssGSEA分析.结果 HNSCC组织中显著差异表达的RNA甲基化调控因子共有38个.LASSO回归模型中,高风险组的5年生存率低于低风险组(P<0.001).单因素与多因素COX回归分析结果 显示该评分模型是HNSCC患者独立的预后因素(P<0.05).GO富集分析和ssGSEA分析提示高风险组的免疫功能可能受到抑制.结论 RNA甲基化调控因子在HNSCC的预后中发挥重要作用.
文献关键词：
RNA甲基化调控因子;头颈部鳞癌;预后;TCGA
中图分类号：
作者姓名：
彭颐;宗丹;葛宜枝;何侠
作者机构：
210009 江苏 南京,南京医科大学附属肿瘤医院/江苏省肿瘤医院/江苏省肿瘤防治研究所;210000 江苏 南京,211166 南京医科大学 第四临床医学院;221004 江苏 徐州,徐州医科大学
文献出处：
引用格式：
[1]彭颐;宗丹;葛宜枝;何侠-.基于TCGA数据库构建头颈部鳞癌RNA甲基化调控因子预后模型)[J].中国肿瘤外科杂志,2022(04):318-325
A类：
B类：
TCGA,数据库构建,头颈部鳞癌,甲基化,调控因子,预后模型,HNSCC,基因表达谱,临床数据,预测预后,LASSO,风险评分,分划,划为,低风险组,差异表达,富集分析,ssGSEA,高风险组,COX,评分模型,预后因素
AB值：
0.244175
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